More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3499 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.42 
 
 		 685 aa  880    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  56.91 
 
 		 713 aa  763    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  74.08 
 
 		 686 aa  989    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  68.74 
 
 		 689 aa  893    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  74.12 
 
 		 686 aa  980    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  71.55 
 
 		 679 aa  929    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.44 
 
 		 686 aa  872    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  71.55 
 
 		 679 aa  929    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  54.93 
 
 		 657 aa  702    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  55.07 
 
 		 657 aa  700    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  78.22 
 
 		 670 aa  1028    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  77.64 
 
 		 673 aa  1021    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  69.01 
 
 		 682 aa  908    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  74.49 
 
 		 695 aa  998    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  69.36 
 
 		 669 aa  854    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  71.85 
 
 		 679 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  83.28 
 
 		 674 aa  1105    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  61.5 
 
 		 650 aa  785    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  73.83 
 
 		 686 aa  987    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  70.7 
 
 		 684 aa  897    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  69.7 
 
 		 684 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  75.67 
 
 		 666 aa  1001    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  59.17 
 
 		 719 aa  769    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  71.55 
 
 		 679 aa  929    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.37 
 
 		 658 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.94 
 
 		 675 aa  933    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  69.58 
 
 		 695 aa  922    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.03 
 
 		 650 aa  769    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.64 
 
 		 652 aa  757    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  71.39 
 
 		 682 aa  930    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  70.85 
 
 		 684 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  64.5 
 
 		 675 aa  823    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  80.59 
 
 		 671 aa  1111    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  67.31 
 
 		 670 aa  854    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  85.42 
 
 		 678 aa  1176    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  69.74 
 
 		 692 aa  924    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  75.4 
 
 		 692 aa  1006    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  70.85 
 
 		 684 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  71.85 
 
 		 679 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  70.7 
 
 		 684 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 		 676 aa  1368    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  71.7 
 
 		 679 aa  930    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  54.67 
 
 		 654 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.46 
 
 		 653 aa  787    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  70.85 
 
 		 684 aa  897    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  71.55 
 
 		 679 aa  929    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  70.85 
 
 		 684 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.92 
 
 		 656 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  83.14 
 
 		 672 aa  1130    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  83.63 
 
 		 678 aa  1132    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  57.04 
 
 		 713 aa  763    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  57.8 
 
 		 724 aa  768    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  77.03 
 
 		 679 aa  1034    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.55 
 
 		 667 aa  759    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  84.62 
 
 		 671 aa  1151    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.19 
 
 		 660 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  50.37 
 
 		 653 aa  622  1e-177  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  50.22 
 
 		 653 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.89 
 
 		 704 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.01 
 
 		 637 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.2 
 
 		 705 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.19 
 
 		 703 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.12 
 
 		 703 aa  558  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.41 
 
 		 641 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.95 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  48.17 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.36 
 
 		 702 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.96 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  47 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.49 
 
 		 701 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  46.76 
 
 		 663 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  46.49 
 
 		 664 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  47.28 
 
 		 701 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  47.74 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.73 
 
 		 643 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  46.1 
 
 		 643 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  45.35 
 
 		 664 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  46.42 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  46.42 
 
 		 661 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  47.71 
 
 		 683 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  47.44 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  45.31 
 
 		 654 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  46.83 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  43.65 
 
 		 689 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  46.84 
 
 		 697 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  44.74 
 
 		 662 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  49.17 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.6 
 
 		 642 aa  505  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  45.52 
 
 		 694 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.94 
 
 		 667 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  41.64 
 
 		 715 aa  492  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  42.86 
 
 		 685 aa  492  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  44.64 
 
 		 681 aa  492  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.75 
 
 		 667 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.45 
 
 		 667 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.29 
 
 		 628 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  41.91 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  41.22 
 
 		 711 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.03 
 
 		 642 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.21 
 
 		 648 aa  462  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>