More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1566 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  58.02 
 
 		 697 aa  693    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.46 
 
 		 641 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  58.82 
 
 		 666 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.16 
 
 		 705 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  58.97 
 
 		 666 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  60.91 
 
 		 661 aa  757    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  60.78 
 
 		 664 aa  764    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.88 
 
 		 666 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.51 
 
 		 704 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.44 
 
 		 702 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  60.61 
 
 		 661 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  57.77 
 
 		 688 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  58.9 
 
 		 654 aa  735    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  58.55 
 
 		 663 aa  727    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.43 
 
 		 643 aa  764    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 643 aa  1278    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  58.51 
 
 		 701 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  55.8 
 
 		 689 aa  687    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  57.54 
 
 		 688 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  60 
 
 		 664 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  59.16 
 
 		 697 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  56.49 
 
 		 683 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  51.2 
 
 		 715 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  50.71 
 
 		 706 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  58.49 
 
 		 681 aa  671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  60.67 
 
 		 662 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.21 
 
 		 712 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.61 
 
 		 703 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  58.97 
 
 		 695 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  53.54 
 
 		 685 aa  666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.25 
 
 		 637 aa  713    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.75 
 
 		 701 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.98 
 
 		 681 aa  716    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.47 
 
 		 703 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.05 
 
 		 642 aa  634  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  51.24 
 
 		 694 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.91 
 
 		 646 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  48.59 
 
 		 711 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  49.29 
 
 		 614 aa  599  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2996  NADH dehydrogenase subunit L  55.75 
 
 		 683 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  48.59 
 
 		 621 aa  592  1e-168  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  48.99 
 
 		 621 aa  586  1e-166  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.16 
 
 		 650 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  47.08 
 
 		 657 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  46.93 
 
 		 657 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.77 
 
 		 653 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  47.02 
 
 		 686 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.69 
 
 		 652 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.77 
 
 		 660 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  49.77 
 
 		 654 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  47.97 
 
 		 650 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.24 
 
 		 675 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.56 
 
 		 675 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  46.43 
 
 		 686 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.42 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  46.26 
 
 		 686 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.26 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  47.58 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.04 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  45.7 
 
 		 682 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  45.7 
 
 		 692 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  47.07 
 
 		 692 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  46.26 
 
 		 695 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  58.68 
 
 		 720 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.14 
 
 		 658 aa  534  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.92 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  58.68 
 
 		 720 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  45.61 
 
 		 679 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  46.13 
 
 		 682 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.97 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.65 
 
 		 678 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.05 
 
 		 678 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.1 
 
 		 676 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.92 
 
 		 672 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  44.31 
 
 		 695 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.71 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  45.41 
 
 		 684 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  45.41 
 
 		 684 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.54 
 
 		 671 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  45.41 
 
 		 684 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.9 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  45.41 
 
 		 684 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  45.41 
 
 		 684 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  45.11 
 
 		 684 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  59.76 
 
 		 703 aa  525  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  45.94 
 
 		 670 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  44.82 
 
 		 653 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  45.26 
 
 		 684 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.75 
 
 		 686 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  44.43 
 
 		 653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.67 
 
 		 685 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.9 
 
 		 674 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.23 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.88 
 
 		 667 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>