More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0758 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  55.65 
 
 		 695 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  55.73 
 
 		 661 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.19 
 
 		 702 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  55.45 
 
 		 661 aa  732    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.47 
 
 		 701 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.75 
 
 		 666 aa  669    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  69.48 
 
 		 715 aa  1005    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  55.09 
 
 		 688 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  69.52 
 
 		 720 aa  972    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.45 
 
 		 705 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  55.49 
 
 		 666 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.06 
 
 		 703 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.61 
 
 		 643 aa  677    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  53.36 
 
 		 654 aa  691    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  54 
 
 		 701 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  51.81 
 
 		 689 aa  697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  53.13 
 
 		 697 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  71.69 
 
 		 711 aa  1034    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  54.36 
 
 		 688 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  53.92 
 
 		 697 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  54.86 
 
 		 683 aa  687    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  49.33 
 
 		 694 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  54.94 
 
 		 666 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  56.98 
 
 		 663 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  76.4 
 
 		 685 aa  1102    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 706 aa  1430    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  54.07 
 
 		 681 aa  698    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  56.02 
 
 		 664 aa  743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.06 
 
 		 703 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  56.17 
 
 		 662 aa  744    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.08 
 
 		 641 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.18 
 
 		 712 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.97 
 
 		 704 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.27 
 
 		 681 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  67 
 
 		 703 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  69.52 
 
 		 720 aa  973    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  54.87 
 
 		 664 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2996  NADH dehydrogenase subunit L  53.15 
 
 		 683 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  50.28 
 
 		 643 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.99 
 
 		 637 aa  612  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.91 
 
 		 642 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  43.98 
 
 		 650 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.29 
 
 		 650 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  43.73 
 
 		 614 aa  517  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  43.43 
 
 		 621 aa  501  1e-140  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  43.56 
 
 		 654 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.56 
 
 		 660 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  40.39 
 
 		 686 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  41.32 
 
 		 682 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  40.76 
 
 		 692 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.96 
 
 		 652 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  40 
 
 		 686 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  40.19 
 
 		 686 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.38 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  41.9 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.08 
 
 		 682 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  40.32 
 
 		 695 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.08 
 
 		 646 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.53 
 
 		 670 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.6 
 
 		 678 aa  489  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.82 
 
 		 653 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  41.35 
 
 		 684 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.62 
 
 		 666 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  41.21 
 
 		 684 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  41.83 
 
 		 657 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  42.5 
 
 		 695 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  41.35 
 
 		 684 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.23 
 
 		 675 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.41 
 
 		 679 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  41.21 
 
 		 684 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  41.35 
 
 		 684 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  41.21 
 
 		 684 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  41.69 
 
 		 657 aa  479  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.69 
 
 		 676 aa  479  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  41.1 
 
 		 669 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  40.8 
 
 		 684 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  42.56 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  41.39 
 
 		 689 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.74 
 
 		 675 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.62 
 
 		 672 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.38 
 
 		 642 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.98 
 
 		 671 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 		 678 aa  475  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.88 
 
 		 674 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  39.95 
 
 		 719 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.08 
 
 		 658 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.94 
 
 		 667 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  40.39 
 
 		 724 aa  469  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.29 
 
 		 667 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.33 
 
 		 667 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  40.19 
 
 		 713 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.18 
 
 		 628 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  51.01 
 
 		 621 aa  460  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>