More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2238 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
684 aa  1371    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  68.14 
 
 
685 aa  878    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.3 
 
 
667 aa  773    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.13 
 
 
674 aa  881    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  71.14 
 
 
676 aa  952    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  75.57 
 
 
686 aa  1018    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.96 
 
 
679 aa  890    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  75.65 
 
 
686 aa  1014    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  91.21 
 
 
679 aa  1229    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  99.12 
 
 
684 aa  1358    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  88.53 
 
 
689 aa  1169    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  91.21 
 
 
679 aa  1229    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  55.13 
 
 
657 aa  721    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  55.13 
 
 
657 aa  718    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  91.35 
 
 
679 aa  1232    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.58 
 
 
656 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  68.08 
 
 
682 aa  916    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  75.21 
 
 
695 aa  1007    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  65.74 
 
 
669 aa  846    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  91.35 
 
 
679 aa  1232    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  62.76 
 
 
650 aa  801    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  91.21 
 
 
679 aa  1229    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  70.54 
 
 
671 aa  941    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  99.71 
 
 
684 aa  1368    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  88.63 
 
 
695 aa  1185    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  55.98 
 
 
654 aa  685    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.98 
 
 
660 aa  684    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  70.54 
 
 
678 aa  946    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.71 
 
 
658 aa  685    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  67.11 
 
 
686 aa  874    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.76 
 
 
666 aa  948    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.29 
 
 
650 aa  797    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  90.67 
 
 
682 aa  1228    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  57.36 
 
 
713 aa  748    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.12 
 
 
675 aa  928    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  67.3 
 
 
671 aa  916    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  67.45 
 
 
670 aa  876    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  70.48 
 
 
678 aa  951    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  89.6 
 
 
692 aa  1194    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.12 
 
 
652 aa  739    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.72 
 
 
673 aa  852    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  74.93 
 
 
692 aa  1009    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  59.16 
 
 
719 aa  759    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
684 aa  1371    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  72.75 
 
 
670 aa  957    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  57.5 
 
 
713 aa  747    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.53 
 
 
653 aa  766    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  75.64 
 
 
686 aa  1023    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  99.12 
 
 
684 aa  1361    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
684 aa  1371    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.62 
 
 
672 aa  950    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  58.95 
 
 
724 aa  771    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  98.1 
 
 
684 aa  1350    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.64 
 
 
675 aa  835    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  91.21 
 
 
679 aa  1229    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  91.5 
 
 
679 aa  1233    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  50.59 
 
 
653 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  50.44 
 
 
653 aa  628  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.53 
 
 
705 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.95 
 
 
704 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.31 
 
 
703 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.44 
 
 
703 aa  594  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.51 
 
 
637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.11 
 
 
702 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.82 
 
 
701 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.94 
 
 
643 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.14 
 
 
666 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.66 
 
 
641 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.97 
 
 
681 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  47.13 
 
 
666 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  47.73 
 
 
701 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  47.27 
 
 
666 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  46.57 
 
 
663 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  45.88 
 
 
664 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  47.27 
 
 
654 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  45.82 
 
 
643 aa  535  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  46.39 
 
 
661 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  45.38 
 
 
664 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  46.99 
 
 
697 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  45.21 
 
 
662 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  44.2 
 
 
685 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  46.11 
 
 
661 aa  525  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  47.2 
 
 
697 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  45.21 
 
 
683 aa  524  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  46.68 
 
 
688 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  45.33 
 
 
688 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.07 
 
 
642 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  48.64 
 
 
695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.59 
 
 
667 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.02 
 
 
667 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.47 
 
 
667 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  42.53 
 
 
711 aa  501  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  41.84 
 
 
706 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  42.88 
 
 
689 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  43.29 
 
 
681 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  44.4 
 
 
694 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.32 
 
 
628 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.68 
 
 
642 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.7 
 
 
676 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.22 
 
 
646 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>