More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5169 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  53.42 
 
 		 654 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  66.76 
 
 		 684 aa  843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  68.84 
 
 		 686 aa  908    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  66.76 
 
 		 679 aa  868    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  69.72 
 
 		 686 aa  922    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.66 
 
 		 666 aa  914    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  54.2 
 
 		 713 aa  707    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 684 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 679 aa  866    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  52.63 
 
 		 657 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  52.63 
 
 		 657 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 679 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.97 
 
 		 656 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  66.47 
 
 		 682 aa  861    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.76 
 
 		 667 aa  732    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.42 
 
 		 660 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  68.51 
 
 		 695 aa  907    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  63.56 
 
 		 685 aa  834    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  63.01 
 
 		 669 aa  811    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  66.76 
 
 		 679 aa  868    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  59.79 
 
 		 650 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.05 
 
 		 652 aa  736    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  66.33 
 
 		 684 aa  839    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  64.13 
 
 		 689 aa  828    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  68.66 
 
 		 686 aa  915    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  55.77 
 
 		 724 aa  728    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  76.88 
 
 		 674 aa  997    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.9 
 
 		 658 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.04 
 
 		 686 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  80.41 
 
 		 671 aa  1064    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.65 
 
 		 650 aa  739    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 682 aa  862    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 679 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.29 
 
 		 675 aa  768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  75.07 
 
 		 671 aa  1008    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  64.34 
 
 		 670 aa  823    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  76.03 
 
 		 678 aa  1050    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  65.57 
 
 		 692 aa  859    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 679 aa  866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  68.18 
 
 		 692 aa  907    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  77.65 
 
 		 676 aa  1034    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  73.48 
 
 		 673 aa  942    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 684 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.32 
 
 		 675 aa  874    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  81.32 
 
 		 678 aa  1075    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.63 
 
 		 653 aa  743    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 684 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  65.58 
 
 		 695 aa  857    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 684 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  82.18 
 
 		 672 aa  1095    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  66.76 
 
 		 679 aa  867    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  66.62 
 
 		 684 aa  839    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 		 679 aa  1369    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  54.06 
 
 		 713 aa  708    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  73.19 
 
 		 670 aa  952    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  55.35 
 
 		 719 aa  709    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  48.6 
 
 		 653 aa  615  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  48.6 
 
 		 653 aa  615  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.44 
 
 		 704 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.55 
 
 		 703 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.43 
 
 		 703 aa  561  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.63 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.55 
 
 		 641 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.25 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.08 
 
 		 702 aa  535  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.81 
 
 		 701 aa  535  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.01 
 
 		 643 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.8 
 
 		 681 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  46.21 
 
 		 701 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  46.53 
 
 		 663 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  46.2 
 
 		 654 aa  522  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.13 
 
 		 666 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  46.51 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  45.78 
 
 		 666 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  45.49 
 
 		 661 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  45.49 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  46.45 
 
 		 697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  45.01 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  45.1 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  46.02 
 
 		 697 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  45.38 
 
 		 643 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  44.81 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  45.13 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  47.8 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  45.65 
 
 		 662 aa  505  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  45.08 
 
 		 683 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  43.24 
 
 		 685 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  42.68 
 
 		 689 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.34 
 
 		 642 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  43.63 
 
 		 694 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  41.12 
 
 		 711 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  41.83 
 
 		 706 aa  482  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  42.61 
 
 		 681 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.55 
 
 		 628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.61 
 
 		 667 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.28 
 
 		 667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.58 
 
 		 667 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.19 
 
 		 642 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  41.74 
 
 		 614 aa  445  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2996  NADH dehydrogenase subunit L  43.49 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>