More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1689 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  58.31 
 
 		 613 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.4 
 
 		 613 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  60.46 
 
 		 617 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  58.24 
 
 		 616 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  57.91 
 
 		 613 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  60.78 
 
 		 615 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  59.8 
 
 		 617 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  58.76 
 
 		 616 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  58.77 
 
 		 614 aa  678    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  58.5 
 
 		 615 aa  658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  59.02 
 
 		 616 aa  658    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  59.8 
 
 		 617 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  84.62 
 
 		 624 aa  1023    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  58.08 
 
 		 613 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  57.94 
 
 		 611 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  58.31 
 
 		 613 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  59.81 
 
 		 617 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  58.43 
 
 		 611 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  57.74 
 
 		 611 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  57.91 
 
 		 613 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  60.46 
 
 		 617 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  57.91 
 
 		 613 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  58.31 
 
 		 613 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  60.13 
 
 		 617 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  84.62 
 
 		 624 aa  1022    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  61.01 
 
 		 615 aa  688    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  58.51 
 
 		 615 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  60.13 
 
 		 617 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 624 aa  1247    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  61.18 
 
 		 615 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  58.61 
 
 		 614 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  58.43 
 
 		 611 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  58.31 
 
 		 613 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  58.61 
 
 		 614 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  58.73 
 
 		 613 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  58.4 
 
 		 613 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  58.84 
 
 		 616 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  58.1 
 
 		 615 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.25 
 
 		 617 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  50.56 
 
 		 613 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.84 
 
 		 618 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.88 
 
 		 621 aa  537  1e-151  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.66 
 
 		 662 aa  514  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.18 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  47.37 
 
 		 657 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.79 
 
 		 622 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.04 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  41.13 
 
 		 636 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.11 
 
 		 630 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.87 
 
 		 642 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.09 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.57 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.55 
 
 		 667 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.59 
 
 		 634 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.1 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.11 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.93 
 
 		 683 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.94 
 
 		 701 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.47 
 
 		 627 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.5 
 
 		 637 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  36.72 
 
 		 689 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.3 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.36 
 
 		 710 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.07 
 
 		 639 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.19 
 
 		 688 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  42.12 
 
 		 666 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  39.82 
 
 		 663 aa  364  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  44.17 
 
 		 624 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  38.98 
 
 		 654 aa  363  6e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  37.2 
 
 		 661 aa  362  8e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.5 
 
 		 668 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  38.46 
 
 		 664 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.58 
 
 		 641 aa  361  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.06 
 
 		 676 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  37.2 
 
 		 661 aa  360  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0320  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.45 
 
 		 666 aa  360  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.36 
 
 		 623 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  52.02 
 
 		 625 aa  359  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  46.04 
 
 		 768 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  37.32 
 
 		 685 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  39.11 
 
 		 620 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  41.29 
 
 		 697 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  45.08 
 
 		 650 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.91 
 
 		 645 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  39.49 
 
 		 683 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  36.09 
 
 		 706 aa  355  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  40 
 
 		 688 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.03 
 
 		 643 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.19 
 
 		 642 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.09 
 
 		 639 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.09 
 
 		 639 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.09 
 
 		 639 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  38.72 
 
 		 620 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.79 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.56 
 
 		 652 aa  351  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.71 
 
 		 770 aa  352  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.68 
 
 		 681 aa  352  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  42.56 
 
 		 697 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.63 
 
 		 653 aa  351  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  38.02 
 
 		 643 aa  350  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>