More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2422 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  68.05 
 
 		 613 aa  806    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  67.88 
 
 		 613 aa  803    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  80.37 
 
 		 617 aa  973    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  58.84 
 
 		 624 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  75.04 
 
 		 615 aa  828    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  79.37 
 
 		 617 aa  931    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  70.57 
 
 		 614 aa  832    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  70.46 
 
 		 615 aa  806    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  70.57 
 
 		 614 aa  831    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  70.3 
 
 		 616 aa  778    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  79.2 
 
 		 617 aa  931    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  59.35 
 
 		 624 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  80.7 
 
 		 617 aa  950    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  80.03 
 
 		 617 aa  942    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  77.76 
 
 		 617 aa  907    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  68.21 
 
 		 613 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  67.94 
 
 		 611 aa  802    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  70.02 
 
 		 616 aa  810    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  81.03 
 
 		 615 aa  929    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  68.21 
 
 		 613 aa  808    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  70.57 
 
 		 614 aa  831    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  68.11 
 
 		 611 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  68.05 
 
 		 613 aa  806    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  63.95 
 
 		 617 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  70.32 
 
 		 616 aa  799    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  58.71 
 
 		 624 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  67.88 
 
 		 613 aa  802    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  80.59 
 
 		 615 aa  954    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  68.21 
 
 		 613 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  70.19 
 
 		 615 aa  769    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  80.53 
 
 		 617 aa  951    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  68.05 
 
 		 613 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  80.7 
 
 		 615 aa  926    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  67.86 
 
 		 611 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  68.05 
 
 		 613 aa  806    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  68.21 
 
 		 613 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  67.94 
 
 		 611 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 616 aa  1202    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  68.21 
 
 		 613 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.27 
 
 		 621 aa  623  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  54.98 
 
 		 613 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.05 
 
 		 618 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.01 
 
 		 618 aa  538  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.86 
 
 		 662 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  51.63 
 
 		 657 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.7 
 
 		 622 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.36 
 
 		 625 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.28 
 
 		 634 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.87 
 
 		 642 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.68 
 
 		 630 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.29 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.38 
 
 		 636 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.94 
 
 		 614 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.36 
 
 		 627 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.97 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43 
 
 		 646 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.83 
 
 		 639 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.68 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.67 
 
 		 642 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.87 
 
 		 676 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  45.15 
 
 		 624 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.17 
 
 		 681 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.88 
 
 		 710 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.11 
 
 		 642 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  42.75 
 
 		 643 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  43.8 
 
 		 688 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.85 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.48 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.48 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.48 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.94 
 
 		 666 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  38.92 
 
 		 621 aa  367  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.09 
 
 		 668 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  44.11 
 
 		 701 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  39.63 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.37 
 
 		 641 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  44.37 
 
 		 625 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  37.62 
 
 		 621 aa  363  6e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  37.68 
 
 		 612 aa  361  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 		 651 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.29 
 
 		 652 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  43.88 
 
 		 768 aa  359  7e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.72 
 
 		 683 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 		 670 aa  359  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  40.2 
 
 		 661 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  37.14 
 
 		 686 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  38.01 
 
 		 685 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.06 
 
 		 703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  44.01 
 
 		 688 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.65 
 
 		 686 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.06 
 
 		 703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  39.38 
 
 		 654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  43.8 
 
 		 697 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  44.23 
 
 		 697 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  37.25 
 
 		 686 aa  357  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.33 
 
 		 650 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  40.37 
 
 		 661 aa  357  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  40.33 
 
 		 664 aa  356  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  38.19 
 
 		 695 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>