More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  69.05 
 
 
613 aa  801    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.05 
 
 
613 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  69.22 
 
 
613 aa  802    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  80.7 
 
 
617 aa  972    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  68.95 
 
 
611 aa  796    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  72.71 
 
 
615 aa  805    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  79.9 
 
 
617 aa  934    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  70.98 
 
 
616 aa  775    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  80.03 
 
 
617 aa  942    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  68.89 
 
 
613 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  79.37 
 
 
617 aa  930    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  59.81 
 
 
624 aa  660    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  69.05 
 
 
613 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  69.86 
 
 
615 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  69.05 
 
 
613 aa  801    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  79.48 
 
 
617 aa  924    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  79.07 
 
 
615 aa  901    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  80.59 
 
 
616 aa  897    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  69.97 
 
 
614 aa  800    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  80.53 
 
 
617 aa  949    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  58.51 
 
 
624 aa  646    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  70.94 
 
 
616 aa  794    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  69.23 
 
 
611 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  70.22 
 
 
613 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  69.05 
 
 
613 aa  801    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  70.98 
 
 
615 aa  791    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  68.95 
 
 
611 aa  795    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  69.05 
 
 
613 aa  801    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  70.12 
 
 
611 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  59.9 
 
 
624 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  71.14 
 
 
616 aa  798    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  69.97 
 
 
614 aa  799    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  69.97 
 
 
614 aa  799    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  70.22 
 
 
613 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  78.74 
 
 
615 aa  900    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  70.22 
 
 
613 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  80.2 
 
 
617 aa  945    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
615 aa  1212    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.74 
 
 
621 aa  623  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.39 
 
 
617 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  54.65 
 
 
613 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  53.19 
 
 
657 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.19 
 
 
662 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.46 
 
 
618 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.29 
 
 
618 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.51 
 
 
622 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.02 
 
 
625 aa  435  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.77 
 
 
667 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.37 
 
 
634 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.47 
 
 
667 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.06 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.43 
 
 
630 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.75 
 
 
642 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.19 
 
 
639 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.4 
 
 
628 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.25 
 
 
637 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  41.11 
 
 
666 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.91 
 
 
710 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  45.23 
 
 
624 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.64 
 
 
642 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.68 
 
 
627 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  38.16 
 
 
636 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.63 
 
 
668 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.11 
 
 
614 aa  369  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.69 
 
 
669 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.71 
 
 
646 aa  369  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.76 
 
 
678 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.49 
 
 
676 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.75 
 
 
686 aa  365  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  44.49 
 
 
692 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.98 
 
 
639 aa  363  6e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  39.5 
 
 
670 aa  362  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.44 
 
 
685 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.22 
 
 
671 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.4 
 
 
679 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.74 
 
 
671 aa  360  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.72 
 
 
642 aa  359  7e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  42.89 
 
 
686 aa  359  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  37.88 
 
 
650 aa  359  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.71 
 
 
642 aa  359  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  42.31 
 
 
695 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  45.42 
 
 
625 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.54 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.54 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.54 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.89 
 
 
683 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.73 
 
 
654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.31 
 
 
674 aa  357  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.82 
 
 
654 aa  356  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.46 
 
 
623 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.8 
 
 
650 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.48 
 
 
673 aa  356  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.53 
 
 
678 aa  356  6.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  39.35 
 
 
654 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.7 
 
 
641 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  40.44 
 
 
620 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  42.89 
 
 
686 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.35 
 
 
660 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.24 
 
 
653 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.44 
 
 
768 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>