More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2762 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  81.79 
 
 		 613 aa  994    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  81.62 
 
 		 613 aa  992    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  72.76 
 
 		 615 aa  828    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  70.81 
 
 		 617 aa  837    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  73.55 
 
 		 615 aa  819    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  70.15 
 
 		 617 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  82.28 
 
 		 613 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  82.39 
 
 		 611 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  81.79 
 
 		 613 aa  995    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  91.2 
 
 		 616 aa  1078    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  70.32 
 
 		 617 aa  808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  58.68 
 
 		 624 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  70.98 
 
 		 617 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  81.62 
 
 		 613 aa  992    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  82.16 
 
 		 611 aa  1012    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  70.34 
 
 		 616 aa  768    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  70.5 
 
 		 617 aa  797    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  82.28 
 
 		 613 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  97.52 
 
 		 616 aa  1156    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  82.12 
 
 		 613 aa  1002    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  82.28 
 
 		 613 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  81.4 
 
 		 611 aa  986    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  82.91 
 
 		 614 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  81.56 
 
 		 611 aa  988    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 615 aa  1222    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  70.65 
 
 		 617 aa  810    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  57.97 
 
 		 624 aa  636    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  81.13 
 
 		 613 aa  987    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  58.2 
 
 		 624 aa  644    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.24 
 
 		 621 aa  719    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  70.62 
 
 		 615 aa  796    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  82.91 
 
 		 614 aa  991    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  81.79 
 
 		 613 aa  994    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  87.37 
 
 		 615 aa  995    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  81.79 
 
 		 613 aa  994    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  72.43 
 
 		 615 aa  824    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  89.59 
 
 		 616 aa  1031    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  70.81 
 
 		 617 aa  814    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  82.91 
 
 		 614 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.16 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  51.39 
 
 		 613 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.67 
 
 		 618 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.58 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.75 
 
 		 662 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.07 
 
 		 657 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.2 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.66 
 
 		 622 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.96 
 
 		 630 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.59 
 
 		 634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.33 
 
 		 667 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.75 
 
 		 642 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  37.3 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.68 
 
 		 667 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  45.5 
 
 		 624 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.88 
 
 		 667 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.44 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.65 
 
 		 639 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  45.04 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  41.62 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.27 
 
 		 627 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.21 
 
 		 652 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.67 
 
 		 650 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.46 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  44.17 
 
 		 654 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.64 
 
 		 710 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.17 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  44.79 
 
 		 692 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  39.62 
 
 		 686 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.19 
 
 		 683 aa  364  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.03 
 
 		 666 aa  363  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  41.03 
 
 		 669 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.28 
 
 		 679 aa  362  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  37.77 
 
 		 614 aa  362  1e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  44.75 
 
 		 682 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.75 
 
 		 642 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.92 
 
 		 637 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.13 
 
 		 678 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  37.76 
 
 		 682 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  37.54 
 
 		 684 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 		 679 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  41.12 
 
 		 695 aa  360  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.39 
 
 		 674 aa  360  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.01 
 
 		 623 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  37.38 
 
 		 684 aa  359  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.86 
 
 		 671 aa  359  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.17 
 
 		 668 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  39.25 
 
 		 663 aa  359  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0320  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.86 
 
 		 666 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.6 
 
 		 671 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  37.38 
 
 		 684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  37.38 
 
 		 684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.81 
 
 		 639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.81 
 
 		 639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.81 
 
 		 639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>