More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1349 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  100 
 
 
613 aa  1199    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.47 
 
 
662 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.97 
 
 
618 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.93 
 
 
618 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  54 
 
 
615 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  52.24 
 
 
617 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  53.21 
 
 
614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  53.21 
 
 
614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  53.21 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  52.04 
 
 
617 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  51.71 
 
 
617 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  52.61 
 
 
611 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  51.74 
 
 
613 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  51.55 
 
 
617 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  51.57 
 
 
613 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  51.57 
 
 
613 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.39 
 
 
613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  51.24 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  52.4 
 
 
617 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  51.57 
 
 
613 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  52.24 
 
 
617 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  52.07 
 
 
617 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  52.73 
 
 
611 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  52.73 
 
 
611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  51.57 
 
 
613 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  54.39 
 
 
615 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  52.55 
 
 
613 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  54.39 
 
 
615 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  55.71 
 
 
657 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  51.9 
 
 
613 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  51.9 
 
 
613 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  52.56 
 
 
611 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  51.9 
 
 
613 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  52.89 
 
 
616 aa  554  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  51.87 
 
 
616 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  51.64 
 
 
616 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  53.57 
 
 
615 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  51.37 
 
 
615 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  54.32 
 
 
616 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  50.56 
 
 
624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  51.79 
 
 
615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  50.16 
 
 
624 aa  514  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.82 
 
 
622 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  50.32 
 
 
624 aa  510  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50 
 
 
625 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.51 
 
 
617 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.02 
 
 
634 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.36 
 
 
630 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.17 
 
 
621 aa  441  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.87 
 
 
627 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.99 
 
 
667 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.23 
 
 
639 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.17 
 
 
642 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.91 
 
 
667 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.23 
 
 
636 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.7 
 
 
667 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.98 
 
 
628 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.15 
 
 
683 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  48.96 
 
 
624 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.29 
 
 
642 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0320  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.29 
 
 
666 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.67 
 
 
642 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.14 
 
 
639 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.68 
 
 
639 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.68 
 
 
639 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.68 
 
 
639 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.03 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.71 
 
 
654 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  41.29 
 
 
666 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.42 
 
 
654 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  46.54 
 
 
682 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.45 
 
 
669 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.88 
 
 
652 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.57 
 
 
641 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  43.83 
 
 
650 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  40.89 
 
 
651 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  57.96 
 
 
625 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  45.03 
 
 
643 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  45.45 
 
 
633 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.3 
 
 
676 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.12 
 
 
668 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  40.99 
 
 
652 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.48 
 
 
675 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  40.15 
 
 
664 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.64 
 
 
701 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  42.86 
 
 
644 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.62 
 
 
623 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.04 
 
 
653 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  39.53 
 
 
661 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  44.41 
 
 
638 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.96 
 
 
666 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 
670 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.14 
 
 
703 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.68 
 
 
670 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.43 
 
 
710 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.68 
 
 
623 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  46.04 
 
 
695 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  39.69 
 
 
664 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.31 
 
 
674 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.7 
 
 
681 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>