More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4452 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  63.78 
 
 
631 aa  712    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  96.17 
 
 
652 aa  1170    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  59.97 
 
 
644 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  56.9 
 
 
662 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  57.72 
 
 
632 aa  646    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.53 
 
 
636 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
651 aa  1270    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  72.79 
 
 
635 aa  828    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  57.61 
 
 
634 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  54.23 
 
 
641 aa  631  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  55.73 
 
 
642 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  54.6 
 
 
642 aa  631  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  53.82 
 
 
636 aa  631  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  56.26 
 
 
643 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0549  NADH dehydrogenase subunit L  56.6 
 
 
661 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  57.49 
 
 
626 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  57.03 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  55.29 
 
 
638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.94 
 
 
649 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  55.26 
 
 
638 aa  595  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1874  NADH dehydrogenase subunit L  57.89 
 
 
626 aa  594  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.815784 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.64 
 
 
649 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  55.61 
 
 
642 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  55.61 
 
 
642 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  55.37 
 
 
640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.91 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.02 
 
 
625 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.13 
 
 
639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  54.03 
 
 
648 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  53.92 
 
 
643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.8 
 
 
628 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.5 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.2 
 
 
630 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.16 
 
 
642 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.12 
 
 
667 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.75 
 
 
667 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.87 
 
 
670 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.18 
 
 
642 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  41.36 
 
 
650 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.81 
 
 
636 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.79 
 
 
637 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  39.79 
 
 
686 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.54 
 
 
642 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.72 
 
 
683 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.75 
 
 
695 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  40.94 
 
 
643 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.29 
 
 
667 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.03 
 
 
666 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.2 
 
 
639 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.07 
 
 
671 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.47 
 
 
676 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 
639 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 
639 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 
639 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  38.89 
 
 
682 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 
627 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.48 
 
 
650 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  39.78 
 
 
692 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  39.14 
 
 
654 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
643 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  41.54 
 
 
701 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  41.28 
 
 
686 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.14 
 
 
660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  38.37 
 
 
682 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  37.73 
 
 
692 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.42 
 
 
710 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 
641 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  41.94 
 
 
666 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.72 
 
 
671 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 
670 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 
642 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  41.94 
 
 
697 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  40.16 
 
 
686 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  37.76 
 
 
695 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.03 
 
 
688 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.74 
 
 
678 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  39.91 
 
 
662 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.25 
 
 
653 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  38.7 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.13 
 
 
668 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.37 
 
 
674 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.12 
 
 
676 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.63 
 
 
675 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  41.88 
 
 
697 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.45 
 
 
678 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.82 
 
 
672 aa  399  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.04 
 
 
614 aa  393  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.79 
 
 
652 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  41.09 
 
 
688 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.9 
 
 
685 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  38.3 
 
 
713 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.85 
 
 
679 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  37.95 
 
 
713 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.89 
 
 
613 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>