More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6083 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  63.27 
 
 
638 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  60.16 
 
 
643 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  61.95 
 
 
633 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
662 aa  1310    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.14 
 
 
636 aa  701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1874  NADH dehydrogenase subunit L  64.38 
 
 
626 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.815784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  57.44 
 
 
641 aa  654    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  62.7 
 
 
635 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  64.99 
 
 
626 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.83 
 
 
649 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0549  NADH dehydrogenase subunit L  84.64 
 
 
661 aa  1032    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  61.72 
 
 
638 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  57.1 
 
 
642 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.34 
 
 
649 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.5 
 
 
625 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  63.14 
 
 
632 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.37 
 
 
631 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  63.51 
 
 
642 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  56.88 
 
 
651 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  62.18 
 
 
644 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  56.79 
 
 
652 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  63.49 
 
 
634 aa  753    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  63.51 
 
 
642 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  55.75 
 
 
642 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  55.3 
 
 
643 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  57.75 
 
 
648 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  53.24 
 
 
636 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.12 
 
 
639 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  57.1 
 
 
640 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.98 
 
 
659 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.86 
 
 
628 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.38 
 
 
634 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.75 
 
 
667 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.79 
 
 
667 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.61 
 
 
637 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.92 
 
 
630 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.65 
 
 
642 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.58 
 
 
650 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.27 
 
 
667 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  41.38 
 
 
663 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.59 
 
 
675 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.6 
 
 
670 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.5 
 
 
642 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.3 
 
 
695 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.63 
 
 
643 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.34 
 
 
627 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.29 
 
 
666 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.81 
 
 
675 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  41.94 
 
 
643 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  41.28 
 
 
662 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.74 
 
 
666 aa  415  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.62 
 
 
682 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.8 
 
 
679 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  40.31 
 
 
692 aa  416  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  42.67 
 
 
664 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  43.61 
 
 
688 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.64 
 
 
701 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.88 
 
 
672 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.21 
 
 
710 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.44 
 
 
676 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.1 
 
 
639 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.1 
 
 
639 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.1 
 
 
639 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  42.11 
 
 
666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.45 
 
 
683 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  39.85 
 
 
686 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  39.88 
 
 
670 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.87 
 
 
650 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.36 
 
 
671 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.16 
 
 
678 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  39.34 
 
 
683 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.25 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  38.94 
 
 
636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.03 
 
 
678 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.67 
 
 
653 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.85 
 
 
671 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  39.32 
 
 
679 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  39.32 
 
 
679 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  39.32 
 
 
679 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  39.48 
 
 
679 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.4 
 
 
660 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 
673 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.71 
 
 
667 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  39.32 
 
 
679 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  39.45 
 
 
682 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  40.4 
 
 
654 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  39.32 
 
 
679 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.81 
 
 
688 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  39.22 
 
 
692 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  42.36 
 
 
695 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.37 
 
 
674 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  39.48 
 
 
679 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  41.26 
 
 
661 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  39.25 
 
 
654 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.6 
 
 
652 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  41.16 
 
 
664 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.68 
 
 
642 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.79 
 
 
639 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  40.24 
 
 
666 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.37 
 
 
641 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>