More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5064 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  59.65 
 
 
638 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
649 aa  1264    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  61.32 
 
 
638 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  57.78 
 
 
632 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  57.98 
 
 
662 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  70.63 
 
 
648 aa  819    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  59.25 
 
 
633 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  64.63 
 
 
642 aa  774    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.35 
 
 
636 aa  776    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  55.68 
 
 
636 aa  652    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.4 
 
 
649 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  55.87 
 
 
641 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  61.62 
 
 
640 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1874  NADH dehydrogenase subunit L  62.9 
 
 
626 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.815784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  60.67 
 
 
642 aa  673    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  57.26 
 
 
644 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  62.42 
 
 
626 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  65.02 
 
 
634 aa  755    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.06 
 
 
631 aa  692    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.6 
 
 
625 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  58.43 
 
 
642 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  59.5 
 
 
643 aa  664    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  60.67 
 
 
642 aa  673    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.55 
 
 
639 aa  633  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0549  NADH dehydrogenase subunit L  57.62 
 
 
661 aa  631  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  54.64 
 
 
651 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.4 
 
 
659 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  53.01 
 
 
643 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  55.84 
 
 
635 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  52.57 
 
 
652 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.08 
 
 
628 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  42.9 
 
 
688 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.5 
 
 
630 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.38 
 
 
667 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  41.04 
 
 
636 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.71 
 
 
643 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.42 
 
 
667 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.73 
 
 
666 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.94 
 
 
642 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.73 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.99 
 
 
650 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.26 
 
 
701 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  42.22 
 
 
688 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.22 
 
 
683 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  44.43 
 
 
697 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.67 
 
 
670 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  42.98 
 
 
697 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.88 
 
 
705 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  40.68 
 
 
663 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  40.83 
 
 
662 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  40.8 
 
 
661 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  38.53 
 
 
682 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.22 
 
 
641 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.01 
 
 
703 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.54 
 
 
671 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.87 
 
 
676 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.16 
 
 
703 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
642 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.48 
 
 
667 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  41.01 
 
 
664 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  40.56 
 
 
683 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  40.43 
 
 
661 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  40.41 
 
 
686 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.71 
 
 
704 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.4 
 
 
666 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.66 
 
 
650 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.82 
 
 
675 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  40.4 
 
 
664 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 
670 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  39.08 
 
 
695 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.26 
 
 
681 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.96 
 
 
642 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.77 
 
 
625 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.3 
 
 
671 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  42.79 
 
 
695 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.28 
 
 
678 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.29 
 
 
710 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  40.74 
 
 
666 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.19 
 
 
637 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  38.43 
 
 
685 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.12 
 
 
660 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  40.89 
 
 
686 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  38.21 
 
 
724 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.99 
 
 
679 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  40.31 
 
 
657 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  39.33 
 
 
669 aa  389  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  40.43 
 
 
666 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  40.38 
 
 
694 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  39.12 
 
 
654 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  39.66 
 
 
689 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.23 
 
 
639 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.5 
 
 
653 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  40.15 
 
 
657 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  40.34 
 
 
654 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  42.17 
 
 
643 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.84 
 
 
678 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.6 
 
 
672 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  38.02 
 
 
692 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.54 
 
 
674 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.64 
 
 
676 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>