More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0292 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  62.46 
 
 		 638 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.87 
 
 		 625 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  100 
 
 		 642 aa  1264    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  58.41 
 
 		 644 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.21 
 
 		 649 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  66.77 
 
 		 648 aa  755    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  65.9 
 
 		 626 aa  710    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  63.26 
 
 		 633 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  55.82 
 
 		 641 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  71.31 
 
 		 636 aa  830    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  64.63 
 
 		 649 aa  756    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  58.36 
 
 		 636 aa  683    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  64.27 
 
 		 638 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  59.59 
 
 		 642 aa  665    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1874  NADH dehydrogenase subunit L  62.64 
 
 		 626 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.815784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  64.06 
 
 		 642 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  61 
 
 		 632 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  67.1 
 
 		 634 aa  786    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  77.8 
 
 		 640 aa  911    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.34 
 
 		 631 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  58.31 
 
 		 643 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  64.06 
 
 		 642 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  57.42 
 
 		 643 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  56.94 
 
 		 662 aa  628  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0549  NADH dehydrogenase subunit L  57.72 
 
 		 661 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  54.6 
 
 		 651 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.6 
 
 		 659 aa  610  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.82 
 
 		 639 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  54.44 
 
 		 652 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  56.82 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.5 
 
 		 683 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.2 
 
 		 628 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.76 
 
 		 630 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.76 
 
 		 642 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.01 
 
 		 666 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.74 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  41.95 
 
 		 661 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.46 
 
 		 639 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.65 
 
 		 643 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.7 
 
 		 667 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  44.41 
 
 		 661 aa  425  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  44.18 
 
 		 664 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.43 
 
 		 667 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.71 
 
 		 667 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  42.16 
 
 		 636 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.08 
 
 		 637 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.61 
 
 		 681 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  45.13 
 
 		 643 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  43.26 
 
 		 688 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.75 
 
 		 676 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  41.23 
 
 		 614 aa  413  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.16 
 
 		 641 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  41.65 
 
 		 664 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.72 
 
 		 642 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  44.28 
 
 		 662 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.96 
 
 		 627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  40.09 
 
 		 654 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  44.76 
 
 		 666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.65 
 
 		 701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.42 
 
 		 710 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  42.97 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  43.92 
 
 		 688 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.54 
 
 		 652 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  42.11 
 
 		 663 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  44.59 
 
 		 666 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.84 
 
 		 668 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.63 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  41.79 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.6 
 
 		 675 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.41 
 
 		 650 aa  399  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.41 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  39.42 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  42.68 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.03 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  44.03 
 
 		 654 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.65 
 
 		 676 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  39.3 
 
 		 695 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.35 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.39 
 
 		 642 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.83 
 
 		 650 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.58 
 
 		 653 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.66 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  46.96 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  43.92 
 
 		 666 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  43.16 
 
 		 683 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.51 
 
 		 639 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  40.5 
 
 		 681 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.36 
 
 		 682 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  37.57 
 
 		 724 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.37 
 
 		 676 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.67 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  40.74 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  41.27 
 
 		 694 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  42.61 
 
 		 657 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  42.78 
 
 		 657 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.7 
 
 		 667 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  44.17 
 
 		 695 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.12 
 
 		 666 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  46.53 
 
 		 711 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.27 
 
 		 671 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>