More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0480 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  58.81 
 
 
638 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  69.31 
 
 
659 aa  774    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
639 aa  1253    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  58.89 
 
 
633 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  59.4 
 
 
638 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.37 
 
 
636 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  56.82 
 
 
642 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  72.16 
 
 
642 aa  831    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.42 
 
 
649 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.55 
 
 
649 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  67.74 
 
 
636 aa  798    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  61.23 
 
 
642 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  62 
 
 
626 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  70.9 
 
 
641 aa  836    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  57.69 
 
 
634 aa  660    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  61.23 
 
 
642 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1874  NADH dehydrogenase subunit L  60.63 
 
 
626 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.815784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  56.37 
 
 
648 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.89 
 
 
625 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  56.13 
 
 
632 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  54.59 
 
 
662 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  53.7 
 
 
644 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.74 
 
 
631 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  54.29 
 
 
651 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  52.06 
 
 
643 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  55.57 
 
 
640 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0549  NADH dehydrogenase subunit L  54.18 
 
 
661 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  54.15 
 
 
643 aa  581  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  53.24 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  53.57 
 
 
652 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.63 
 
 
630 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.01 
 
 
676 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.93 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.93 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.93 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.99 
 
 
634 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.06 
 
 
625 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.79 
 
 
667 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.39 
 
 
642 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.25 
 
 
667 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.52 
 
 
667 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.86 
 
 
801 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289204  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.42 
 
 
636 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.18 
 
 
628 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.87 
 
 
710 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.65 
 
 
639 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.4 
 
 
662 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.06 
 
 
688 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 
637 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.63 
 
 
702 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.59 
 
 
666 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.11 
 
 
639 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.64 
 
 
704 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.32 
 
 
643 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.21 
 
 
668 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.36 
 
 
666 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  36.12 
 
 
610 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.09 
 
 
705 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  41.01 
 
 
701 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0149  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.09 
 
 
618 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000427063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.59 
 
 
642 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.29 
 
 
614 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.83 
 
 
681 aa  369  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  36.74 
 
 
695 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.18 
 
 
642 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.6 
 
 
683 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  42.02 
 
 
643 aa  369  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.72 
 
 
641 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.88 
 
 
703 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  41.02 
 
 
663 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  41.48 
 
 
697 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.97 
 
 
627 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.62 
 
 
669 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.88 
 
 
703 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.61 
 
 
642 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.08 
 
 
676 aa  364  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.42 
 
 
678 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
676 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.91 
 
 
676 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  36.75 
 
 
692 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.99 
 
 
653 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  42.01 
 
 
664 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.58 
 
 
670 aa  361  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.24 
 
 
676 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  41.26 
 
 
697 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  44.18 
 
 
694 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.88 
 
 
675 aa  360  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3868  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.2 
 
 
696 aa  360  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.46 
 
 
666 aa  359  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  40.57 
 
 
724 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.33 
 
 
701 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.6 
 
 
618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.12 
 
 
676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.08 
 
 
712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  42.27 
 
 
661 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  36.43 
 
 
670 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.05 
 
 
671 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  45.63 
 
 
715 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.85 
 
 
670 aa  357  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  37.42 
 
 
650 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>