More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3815 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
618 aa  1248    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.86 
 
 
662 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  51.93 
 
 
613 aa  581  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.25 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
611 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  49.25 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
611 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  50.54 
 
 
657 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  49.25 
 
 
613 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.25 
 
 
618 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  48.18 
 
 
611 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  48.8 
 
 
614 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  48.63 
 
 
614 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  48.63 
 
 
614 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  48.58 
 
 
611 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  48.58 
 
 
613 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  48.58 
 
 
613 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  48.58 
 
 
613 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  47.99 
 
 
613 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  48.45 
 
 
616 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  48.84 
 
 
617 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  49.26 
 
 
616 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  47.5 
 
 
616 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  48.26 
 
 
615 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  47.6 
 
 
617 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  47.43 
 
 
617 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  46.84 
 
 
615 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  48.43 
 
 
617 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  48.26 
 
 
617 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  48.43 
 
 
617 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  48.65 
 
 
615 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  48.29 
 
 
615 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  47.73 
 
 
624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  48.65 
 
 
615 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  47.4 
 
 
624 aa  513  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  47.73 
 
 
617 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  47.69 
 
 
615 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  46.84 
 
 
624 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.48 
 
 
622 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  48.01 
 
 
616 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.99 
 
 
621 aa  449  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.04 
 
 
625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.03 
 
 
630 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.46 
 
 
617 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  38.19 
 
 
636 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.28 
 
 
642 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.52 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.52 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.52 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.18 
 
 
667 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.85 
 
 
639 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.94 
 
 
634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.53 
 
 
628 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.94 
 
 
627 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.46 
 
 
642 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  44.04 
 
 
624 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.14 
 
 
667 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.77 
 
 
666 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.14 
 
 
667 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.54 
 
 
654 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.42 
 
 
801 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289204  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  39.15 
 
 
654 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.48 
 
 
710 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.31 
 
 
639 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.6 
 
 
623 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.98 
 
 
642 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  39.97 
 
 
633 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.7 
 
 
654 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  38.34 
 
 
650 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0320  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.06 
 
 
666 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  40.8 
 
 
701 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40 
 
 
641 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.22 
 
 
666 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40 
 
 
636 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.24 
 
 
683 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.21 
 
 
614 aa  375  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.71 
 
 
646 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.36 
 
 
651 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  41.35 
 
 
697 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.35 
 
 
656 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  39.07 
 
 
663 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.03 
 
 
669 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.36 
 
 
643 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  37.85 
 
 
641 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.97 
 
 
637 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  40.87 
 
 
626 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.31 
 
 
623 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  46.23 
 
 
625 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.41 
 
 
642 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  38.78 
 
 
644 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  39.27 
 
 
620 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  39.3 
 
 
688 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.56 
 
 
681 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.4 
 
 
662 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.09 
 
 
676 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  39.75 
 
 
613 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>