More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1023 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  56.47 
 
 
613 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.95 
 
 
618 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  61.76 
 
 
657 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
662 aa  1311    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.38 
 
 
618 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  50.39 
 
 
617 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  51.93 
 
 
615 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  50.96 
 
 
614 aa  558  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  50.96 
 
 
614 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  50.96 
 
 
614 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  50.62 
 
 
617 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  50.47 
 
 
617 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  50.23 
 
 
617 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  49.61 
 
 
617 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  49.3 
 
 
617 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  50.15 
 
 
617 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  53.41 
 
 
615 aa  535  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  51.19 
 
 
615 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  48.85 
 
 
616 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  51.19 
 
 
615 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  50.17 
 
 
613 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.17 
 
 
613 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  50.17 
 
 
613 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  50.17 
 
 
613 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  50.17 
 
 
613 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  52.12 
 
 
616 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  50.34 
 
 
611 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  50.17 
 
 
613 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  49.83 
 
 
613 aa  521  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  50.34 
 
 
611 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  49.04 
 
 
615 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  46.52 
 
 
611 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  50 
 
 
616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  49.24 
 
 
613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  49.24 
 
 
613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  49.41 
 
 
611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  49.16 
 
 
613 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  49.24 
 
 
613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  48.47 
 
 
624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  48.31 
 
 
624 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  47.6 
 
 
624 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  48.88 
 
 
615 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  50.46 
 
 
616 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.12 
 
 
622 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.13 
 
 
625 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.53 
 
 
617 aa  458  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.14 
 
 
630 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.52 
 
 
667 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.82 
 
 
667 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.76 
 
 
634 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.56 
 
 
667 aa  435  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.09 
 
 
621 aa  427  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.88 
 
 
668 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.04 
 
 
710 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  40.09 
 
 
636 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.38 
 
 
666 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  48.96 
 
 
624 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.62 
 
 
669 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.78 
 
 
627 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.24 
 
 
642 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.62 
 
 
642 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.91 
 
 
639 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.67 
 
 
639 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
639 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
639 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
639 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.63 
 
 
625 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.39 
 
 
628 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.83 
 
 
656 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0320  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.31 
 
 
666 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.77 
 
 
623 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.82 
 
 
676 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
661 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
661 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  38.69 
 
 
620 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  37.22 
 
 
654 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.68 
 
 
642 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.37 
 
 
652 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.67 
 
 
623 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  39.74 
 
 
664 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.88 
 
 
653 aa  369  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.93 
 
 
641 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  38.93 
 
 
620 aa  363  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  38.62 
 
 
620 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  38.47 
 
 
620 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.62 
 
 
676 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  39.52 
 
 
664 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.12 
 
 
676 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.57 
 
 
650 aa  363  8e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  39.66 
 
 
701 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.43 
 
 
654 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  41.81 
 
 
633 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  38.47 
 
 
620 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  43.33 
 
 
620 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  36.95 
 
 
711 aa  362  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 
678 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.58 
 
 
671 aa  361  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.6 
 
 
676 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  43.31 
 
 
620 aa  361  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.23 
 
 
662 aa  360  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>