More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1184 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
516 aa  1011    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  50.2 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  45.02 
 
 
527 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  45.02 
 
 
527 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  37.5 
 
 
537 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  40.3 
 
 
518 aa  267  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  50.9 
 
 
542 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.57 
 
 
519 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  43.01 
 
 
535 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  40.13 
 
 
519 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  44.29 
 
 
509 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  45.02 
 
 
524 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  48 
 
 
524 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  40.73 
 
 
519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  47.6 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.2 
 
 
516 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  40.78 
 
 
523 aa  232  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 
528 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  37.19 
 
 
546 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.89 
 
 
546 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0212  NADH dehydrogenase (quinone)  40.09 
 
 
551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  39.57 
 
 
519 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.89 
 
 
523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  49.82 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 
1382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  40.49 
 
 
501 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.97 
 
 
559 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  37.09 
 
 
615 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  32.48 
 
 
529 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  38.16 
 
 
559 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  35.52 
 
 
615 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.1 
 
 
560 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  34.39 
 
 
614 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  35.71 
 
 
613 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  34.39 
 
 
614 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  34.39 
 
 
614 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  35.52 
 
 
616 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  35.03 
 
 
613 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  35.03 
 
 
613 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  35.03 
 
 
611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  35.03 
 
 
613 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  35.03 
 
 
611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  34.89 
 
 
617 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  33.12 
 
 
614 aa  156  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  35.02 
 
 
617 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.6 
 
 
565 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  34.78 
 
 
617 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.53 
 
 
617 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  34.6 
 
 
616 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  35.59 
 
 
616 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.6 
 
 
565 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.69 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  35.4 
 
 
615 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  34.69 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
613 aa  154  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.65 
 
 
643 aa  153  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.24 
 
 
566 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  30.61 
 
 
612 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  34.71 
 
 
768 aa  150  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  35.17 
 
 
624 aa  150  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  35.17 
 
 
624 aa  150  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  32.88 
 
 
663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.44 
 
 
681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  31.65 
 
 
688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.77 
 
 
641 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  36 
 
 
615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  32.2 
 
 
664 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.49 
 
 
646 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.88 
 
 
642 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  35.54 
 
 
615 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.98 
 
 
770 aa  148  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  29.74 
 
 
720 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  29.74 
 
 
720 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  32.46 
 
 
715 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  34.72 
 
 
615 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  31.79 
 
 
701 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.88 
 
 
618 aa  147  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  34.28 
 
 
770 aa  147  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.56 
 
 
618 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.9 
 
 
759 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.55 
 
 
758 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  32.13 
 
 
685 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  29.07 
 
 
666 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.57 
 
 
750 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.57 
 
 
762 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  32.43 
 
 
666 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  31.15 
 
 
706 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  32.23 
 
 
683 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.08 
 
 
702 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0149  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.65 
 
 
618 aa  144  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000427063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.86 
 
 
686 aa  144  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  37.2 
 
 
495 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.35 
 
 
712 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>