More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4034 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
509 aa  950    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  60 
 
 
527 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  60 
 
 
527 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  56.25 
 
 
535 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  43.04 
 
 
516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  55.36 
 
 
510 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  35.83 
 
 
518 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  45.72 
 
 
542 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  47.62 
 
 
524 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.56 
 
 
546 aa  210  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  38.56 
 
 
546 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0212  NADH dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
551 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  43.06 
 
 
528 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  38.24 
 
 
537 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 
524 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  43.92 
 
 
470 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.03 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.45 
 
 
519 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  41.61 
 
 
526 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  45.02 
 
 
519 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 
519 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.24 
 
 
523 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  47.04 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  38.81 
 
 
1382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 
554 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 
519 aa  172  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.73 
 
 
566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.89 
 
 
565 aa  156  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.89 
 
 
565 aa  156  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  38.1 
 
 
559 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  40.14 
 
 
501 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.04 
 
 
559 aa  147  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.64 
 
 
560 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  30.47 
 
 
529 aa  141  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.29 
 
 
642 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  30.88 
 
 
614 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  36.15 
 
 
495 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1866  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  32.2 
 
 
610 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  28.17 
 
 
621 aa  134  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.35 
 
 
643 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  26.04 
 
 
621 aa  134  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.94 
 
 
667 aa  133  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.19 
 
 
642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.09 
 
 
625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  33.58 
 
 
633 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.09 
 
 
675 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.46 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5482  NADH dehydrogenase (quinone)  33.93 
 
 
847 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120155  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.47 
 
 
649 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.97 
 
 
666 aa  130  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.02 
 
 
639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  32.85 
 
 
711 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  28.53 
 
 
692 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  28.83 
 
 
695 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  30 
 
 
651 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  28.83 
 
 
695 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  34.33 
 
 
636 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.62 
 
 
681 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  30.82 
 
 
688 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  29.17 
 
 
662 aa  126  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  31.31 
 
 
694 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.62 
 
 
642 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0149  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.24 
 
 
618 aa  126  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000427063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  29.26 
 
 
652 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  29.67 
 
 
666 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1817  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
640 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000815464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  32.5 
 
 
685 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  32.21 
 
 
643 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  31.67 
 
 
706 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.12 
 
 
636 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.33 
 
 
712 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.36 
 
 
641 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  31.85 
 
 
506 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  32.08 
 
 
506 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.74 
 
 
696 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.42 
 
 
628 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  28.53 
 
 
692 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  30.94 
 
 
654 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 
640 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.3 
 
 
702 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.94 
 
 
660 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  33.57 
 
 
715 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.03 
 
 
710 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.72 
 
 
649 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  30.91 
 
 
653 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.2 
 
 
704 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  30.91 
 
 
653 aa  124  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  31.14 
 
 
634 aa  123  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  30.65 
 
 
686 aa  123  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  32.11 
 
 
642 aa  123  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  31.92 
 
 
695 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  31.99 
 
 
701 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.15 
 
 
671 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0297  NADH dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00538088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.19 
 
 
725 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  33.21 
 
 
720 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.95 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.95 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.95 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>