More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0133 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 1382 aa  2727    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  54.84 
 
 		 825 aa  832    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  54.84 
 
 		 825 aa  830    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  44 
 
 		 839 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  44.91 
 
 		 843 aa  629  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  42.61 
 
 		 827 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  43.13 
 
 		 840 aa  615  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  44.46 
 
 		 844 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  42.98 
 
 		 838 aa  598  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  41.64 
 
 		 815 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  42.31 
 
 		 808 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  37.73 
 
 		 823 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  53.66 
 
 		 546 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  53.25 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  40.84 
 
 		 862 aa  516  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  42.64 
 
 		 808 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  41.39 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  40.45 
 
 		 808 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  41.41 
 
 		 860 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  41.41 
 
 		 860 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  40.79 
 
 		 808 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  39.42 
 
 		 869 aa  489  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  41.85 
 
 		 825 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  39.43 
 
 		 791 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  41.56 
 
 		 812 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  40.54 
 
 		 812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  38.59 
 
 		 805 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  37.83 
 
 		 801 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  34.84 
 
 		 810 aa  440  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  35.39 
 
 		 837 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  34.92 
 
 		 805 aa  365  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  36.11 
 
 		 749 aa  364  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  33.96 
 
 		 762 aa  361  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  33.72 
 
 		 762 aa  360  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  34.55 
 
 		 805 aa  352  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  34.94 
 
 		 870 aa  352  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  29.89 
 
 		 868 aa  322  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  31.09 
 
 		 881 aa  320  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.43 
 
 		 868 aa  319  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  29.63 
 
 		 874 aa  317  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  29.63 
 
 		 874 aa  318  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  29.63 
 
 		 874 aa  317  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  29.41 
 
 		 874 aa  317  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  29.52 
 
 		 874 aa  314  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  33.8 
 
 		 852 aa  312  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  29 
 
 		 874 aa  311  8e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  28.56 
 
 		 855 aa  309  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  28.78 
 
 		 874 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  29.41 
 
 		 874 aa  299  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  31.75 
 
 		 848 aa  294  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  28.85 
 
 		 901 aa  282  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  28.85 
 
 		 901 aa  282  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  28.67 
 
 		 961 aa  256  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  42.69 
 
 		 1043 aa  251  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0212  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 		 551 aa  251  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  42.68 
 
 		 1044 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1073 aa  242  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 		 524 aa  241  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  35.47 
 
 		 524 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  28.42 
 
 		 845 aa  235  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  41.69 
 
 		 1046 aa  234  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  44.16 
 
 		 1037 aa  234  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  37.99 
 
 		 528 aa  233  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  43.83 
 
 		 1037 aa  230  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  37.67 
 
 		 542 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  35.32 
 
 		 526 aa  229  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1012 aa  221  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  33.65 
 
 		 996 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1099 aa  218  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  26.56 
 
 		 831 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  26.38 
 
 		 915 aa  211  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1039 aa  208  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  40.84 
 
 		 1039 aa  202  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.34 
 
 		 519 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.78 
 
 		 516 aa  198  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1125 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  34.48 
 
 		 984 aa  196  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  36.59 
 
 		 470 aa  194  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  36.91 
 
 		 519 aa  191  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.42 
 
 		 523 aa  188  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 519 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  43.43 
 
 		 510 aa  182  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  34.57 
 
 		 523 aa  179  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  41.82 
 
 		 537 aa  178  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  41.09 
 
 		 518 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  37.44 
 
 		 519 aa  174  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  31.92 
 
 		 516 aa  174  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  38.18 
 
 		 501 aa  164  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  39.93 
 
 		 527 aa  159  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  39.93 
 
 		 527 aa  159  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  40.89 
 
 		 509 aa  154  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  40.14 
 
 		 535 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.68 
 
 		 625 aa  145  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.63 
 
 		 649 aa  142  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  31.23 
 
 		 633 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.27 
 
 		 631 aa  140  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  33.21 
 
 		 612 aa  139  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.5 
 
 		 691 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  37.88 
 
 		 554 aa  138  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  31.37 
 
 		 641 aa  137  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0146936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>