67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1358 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  54.84 
 
 		 1382 aa  847    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  48.91 
 
 		 839 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  99.39 
 
 		 825 aa  1698    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  49.57 
 
 		 840 aa  741    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  48.07 
 
 		 838 aa  724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  48.41 
 
 		 843 aa  733    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  48.25 
 
 		 844 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  45.83 
 
 		 827 aa  714    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 825 aa  1709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  44.08 
 
 		 808 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  43.32 
 
 		 808 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  41.84 
 
 		 808 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  42.65 
 
 		 808 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  44.77 
 
 		 812 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  42.12 
 
 		 815 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  44.7 
 
 		 812 aa  593  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  42.43 
 
 		 801 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  40.51 
 
 		 823 aa  592  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  41.22 
 
 		 862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  39.48 
 
 		 869 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  39.68 
 
 		 805 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  40.44 
 
 		 791 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  42.21 
 
 		 825 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  40.82 
 
 		 860 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  40.82 
 
 		 860 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  37.4 
 
 		 801 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  36.3 
 
 		 810 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  34.37 
 
 		 837 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  32.15 
 
 		 762 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  32.02 
 
 		 762 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  34.68 
 
 		 805 aa  381  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  35.06 
 
 		 805 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  36.1 
 
 		 749 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  33.92 
 
 		 852 aa  346  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  30.14 
 
 		 874 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  31.24 
 
 		 881 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.88 
 
 		 868 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  29.66 
 
 		 868 aa  336  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  29.71 
 
 		 874 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  30.05 
 
 		 870 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  29.68 
 
 		 874 aa  331  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  29.01 
 
 		 874 aa  330  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  29.01 
 
 		 874 aa  330  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  29.01 
 
 		 874 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  28.98 
 
 		 874 aa  328  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  31.56 
 
 		 874 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  28.6 
 
 		 855 aa  321  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1037 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  29.87 
 
 		 848 aa  280  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  33.2 
 
 		 901 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  33.2 
 
 		 901 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  31.05 
 
 		 961 aa  269  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  43.79 
 
 		 1044 aa  264  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  42.46 
 
 		 1043 aa  252  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  43.18 
 
 		 1046 aa  249  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1073 aa  248  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  43.65 
 
 		 1037 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1012 aa  244  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  27.74 
 
 		 831 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  27.85 
 
 		 845 aa  230  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  26.77 
 
 		 915 aa  230  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1039 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  32.23 
 
 		 996 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  28.98 
 
 		 984 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  40.07 
 
 		 1039 aa  214  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1099 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1125 aa  207  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>