67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2475 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  100 
 
 
852 aa  1703    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  36.69 
 
 
837 aa  478  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  37.58 
 
 
805 aa  458  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  36.06 
 
 
805 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  34.51 
 
 
762 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  34.38 
 
 
762 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  35.02 
 
 
749 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  35.07 
 
 
839 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  36.06 
 
 
843 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  35.48 
 
 
838 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  36.79 
 
 
844 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  31.15 
 
 
868 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  30.36 
 
 
874 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  31.05 
 
 
868 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  30.42 
 
 
874 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  35.5 
 
 
840 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  30.62 
 
 
874 aa  376  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  33.64 
 
 
825 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  33.75 
 
 
825 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  31.07 
 
 
874 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  31.07 
 
 
874 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  31.07 
 
 
874 aa  364  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  33.33 
 
 
862 aa  363  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  34.5 
 
 
827 aa  362  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  30.98 
 
 
874 aa  361  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  31.03 
 
 
874 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  35.89 
 
 
881 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  35.55 
 
 
815 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  29.08 
 
 
855 aa  354  4e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  32 
 
 
870 aa  347  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  33.25 
 
 
810 aa  346  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  33.82 
 
 
801 aa  344  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 
1382 aa  342  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  36.23 
 
 
860 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  36.23 
 
 
860 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  33.62 
 
 
808 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  34.57 
 
 
869 aa  336  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  33.21 
 
 
823 aa  335  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  34.56 
 
 
808 aa  334  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  36.84 
 
 
825 aa  331  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  33.7 
 
 
808 aa  331  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  33.68 
 
 
801 aa  328  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  25.93 
 
 
961 aa  327  7e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  32.08 
 
 
805 aa  323  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
808 aa  320  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  26.79 
 
 
901 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  26.79 
 
 
901 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  35.92 
 
 
812 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  32.62 
 
 
791 aa  313  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  32.05 
 
 
848 aa  308  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  42.02 
 
 
812 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  44.25 
 
 
1037 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  44.25 
 
 
1037 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  41.18 
 
 
1044 aa  269  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  41.67 
 
 
1046 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  41.28 
 
 
1039 aa  259  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  40.7 
 
 
1039 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  29.67 
 
 
1012 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  38.78 
 
 
1043 aa  251  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  33.02 
 
 
1073 aa  239  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  33.33 
 
 
845 aa  238  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  32.82 
 
 
831 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  30.99 
 
 
1099 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  29.05 
 
 
984 aa  218  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  34.4 
 
 
996 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  29.28 
 
 
1125 aa  200  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  28.31 
 
 
915 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>