67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00907 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  63.11 
 
 
812 aa  901    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  61.18 
 
 
801 aa  927    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  47.93 
 
 
838 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  65.23 
 
 
808 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  47.76 
 
 
840 aa  684    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  54.33 
 
 
791 aa  771    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  56.42 
 
 
805 aa  860    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  100 
 
 
812 aa  1623    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  65.53 
 
 
808 aa  989    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  47.4 
 
 
839 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  64.28 
 
 
808 aa  959    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  62.88 
 
 
808 aa  931    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  44.85 
 
 
843 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  44.19 
 
 
825 aa  611  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  43.95 
 
 
825 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  42.52 
 
 
844 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  41.08 
 
 
827 aa  555  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  40.05 
 
 
1382 aa  500  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  40 
 
 
815 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  37.14 
 
 
823 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  37.67 
 
 
862 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  38.01 
 
 
869 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  34.75 
 
 
810 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  40.02 
 
 
825 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  38.19 
 
 
801 aa  426  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  39.35 
 
 
860 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  39.35 
 
 
860 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  34.92 
 
 
762 aa  361  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  34.65 
 
 
762 aa  359  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  33.73 
 
 
837 aa  345  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  33.13 
 
 
805 aa  342  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  30.15 
 
 
874 aa  334  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  36.12 
 
 
749 aa  333  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  31.63 
 
 
881 aa  331  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  30.16 
 
 
874 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  30.16 
 
 
874 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  29.62 
 
 
874 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  29.98 
 
 
874 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  29.93 
 
 
874 aa  328  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.85 
 
 
868 aa  328  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  29.77 
 
 
868 aa  324  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  33.69 
 
 
805 aa  323  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  29.39 
 
 
874 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  33.99 
 
 
852 aa  317  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  28.6 
 
 
874 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  30.32 
 
 
855 aa  305  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  31.43 
 
 
870 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  35.28 
 
 
901 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  35.28 
 
 
901 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  35.53 
 
 
848 aa  276  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  45.11 
 
 
1037 aa  251  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  41.21 
 
 
1043 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  44.48 
 
 
1037 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  41.79 
 
 
1044 aa  238  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  39.87 
 
 
961 aa  237  5.0000000000000005e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  41.61 
 
 
1046 aa  232  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  43.85 
 
 
1039 aa  225  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  43.22 
 
 
1039 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  34.9 
 
 
1073 aa  208  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 
1012 aa  208  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  26.92 
 
 
831 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  31.65 
 
 
845 aa  197  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  29.15 
 
 
915 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  32.53 
 
 
1125 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  38.26 
 
 
1099 aa  180  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  33.81 
 
 
984 aa  178  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  30.2 
 
 
996 aa  164  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>