67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3405 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  45.61 
 
 		 838 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  56.48 
 
 		 805 aa  852    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  100 
 
 		 808 aa  1617    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  66.23 
 
 		 812 aa  947    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  63.77 
 
 		 808 aa  961    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  62.92 
 
 		 812 aa  885    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  61.23 
 
 		 801 aa  929    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  55.14 
 
 		 791 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  47.3 
 
 		 840 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  62.65 
 
 		 808 aa  938    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  46.19 
 
 		 839 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  63.76 
 
 		 808 aa  934    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  45.83 
 
 		 843 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  42.87 
 
 		 825 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  43.56 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  42.75 
 
 		 825 aa  592  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  41.67 
 
 		 827 aa  561  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  39.98 
 
 		 1382 aa  511  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  40.42 
 
 		 815 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  37.02 
 
 		 823 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  37.93 
 
 		 869 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  35.37 
 
 		 862 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  39.1 
 
 		 825 aa  438  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  38.81 
 
 		 860 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  38.81 
 
 		 860 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  34.26 
 
 		 810 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  36.66 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  35.74 
 
 		 762 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  36.32 
 
 		 762 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  37.96 
 
 		 749 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  34.14 
 
 		 805 aa  348  3e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  29.91 
 
 		 874 aa  344  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  32.45 
 
 		 837 aa  344  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  30.41 
 
 		 868 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  30.23 
 
 		 874 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  30.47 
 
 		 874 aa  340  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  30.47 
 
 		 874 aa  340  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  30.49 
 
 		 874 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  30.27 
 
 		 874 aa  337  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  30.37 
 
 		 868 aa  337  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  32.38 
 
 		 870 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  30.43 
 
 		 874 aa  336  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  33.77 
 
 		 805 aa  331  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  31.45 
 
 		 881 aa  330  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  30.24 
 
 		 874 aa  325  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  28.41 
 
 		 855 aa  320  7.999999999999999e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  32.65 
 
 		 852 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  35.89 
 
 		 901 aa  293  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  35.89 
 
 		 901 aa  293  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  34.85 
 
 		 848 aa  277  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  43.71 
 
 		 1037 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1037 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  43.37 
 
 		 1044 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  31.26 
 
 		 845 aa  240  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  41.81 
 
 		 1046 aa  235  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1043 aa  233  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  38.96 
 
 		 961 aa  233  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1012 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1073 aa  225  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  41.47 
 
 		 1039 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  28.67 
 
 		 915 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  40.88 
 
 		 1039 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  39.89 
 
 		 1099 aa  213  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  32.33 
 
 		 831 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  34.96 
 
 		 984 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1125 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  31.06 
 
 		 996 aa  185  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>