67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2332 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  65.31 
 
 
812 aa  976    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  66.49 
 
 
801 aa  1011    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  45.24 
 
 
843 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  46.49 
 
 
838 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  48.46 
 
 
840 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  73.44 
 
 
808 aa  1118    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  52.17 
 
 
791 aa  740    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  100 
 
 
808 aa  1620    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  63.21 
 
 
812 aa  920    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  63.77 
 
 
808 aa  977    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  48.01 
 
 
839 aa  683    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  71.78 
 
 
808 aa  1113    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  58.89 
 
 
805 aa  898    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  42.13 
 
 
825 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  42.04 
 
 
825 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  44.84 
 
 
844 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  41.81 
 
 
827 aa  558  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  40.94 
 
 
1382 aa  509  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  40.88 
 
 
815 aa  502  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  37.07 
 
 
823 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  37.01 
 
 
862 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  38.72 
 
 
869 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  39.71 
 
 
860 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  39.71 
 
 
860 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  39.19 
 
 
825 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  35.54 
 
 
810 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  36.7 
 
 
801 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  36.15 
 
 
762 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  35.67 
 
 
762 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  33.57 
 
 
837 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  37.05 
 
 
749 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  32.81 
 
 
805 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  34.09 
 
 
805 aa  337  5.999999999999999e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  30.29 
 
 
874 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  30.29 
 
 
874 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  30.29 
 
 
874 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  30.18 
 
 
874 aa  331  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  29.75 
 
 
868 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  30.5 
 
 
874 aa  327  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  29.23 
 
 
874 aa  324  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  29.31 
 
 
874 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.14 
 
 
868 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  30.35 
 
 
874 aa  317  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  34.31 
 
 
881 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  28.6 
 
 
855 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  30.95 
 
 
870 aa  311  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  36.33 
 
 
901 aa  280  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  36.33 
 
 
901 aa  280  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  34.55 
 
 
848 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  47.12 
 
 
852 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  38.39 
 
 
961 aa  242  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  41.16 
 
 
1037 aa  230  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  39.23 
 
 
1046 aa  229  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  40.71 
 
 
1044 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  40.58 
 
 
1037 aa  224  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  40 
 
 
1043 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  33.59 
 
 
1012 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  39.88 
 
 
1039 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  31.8 
 
 
831 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  26.5 
 
 
845 aa  202  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  39.31 
 
 
1039 aa  198  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  35.2 
 
 
984 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  30.95 
 
 
1099 aa  197  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  32.19 
 
 
1073 aa  193  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  25.18 
 
 
915 aa  191  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  29.78 
 
 
1125 aa  174  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  30.91 
 
 
996 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>