67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2020 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 815 aa  1602    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  47.18 
 
 		 862 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  44.64 
 
 		 869 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  48.3 
 
 		 825 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  43.34 
 
 		 823 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  45.37 
 
 		 860 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  45.37 
 
 		 860 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  41.87 
 
 		 825 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  41.75 
 
 		 825 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  42.03 
 
 		 840 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  41.26 
 
 		 838 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  40.22 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  40.38 
 
 		 839 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  40.19 
 
 		 843 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  39.1 
 
 		 810 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 		 1382 aa  525  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  39.15 
 
 		 844 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  40.55 
 
 		 808 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  41.18 
 
 		 808 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  38.94 
 
 		 801 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  41.22 
 
 		 808 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  39.65 
 
 		 808 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  38.97 
 
 		 801 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  40.65 
 
 		 812 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  38.35 
 
 		 791 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  37.7 
 
 		 805 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  40.36 
 
 		 812 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  36.83 
 
 		 749 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  34.62 
 
 		 805 aa  349  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  32.84 
 
 		 762 aa  346  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  31.98 
 
 		 762 aa  344  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  32.05 
 
 		 837 aa  343  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  33.21 
 
 		 870 aa  343  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  31.78 
 
 		 805 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  32.15 
 
 		 855 aa  334  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  31.51 
 
 		 881 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  30 
 
 		 868 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  35.77 
 
 		 852 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  29.36 
 
 		 874 aa  319  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  29.89 
 
 		 874 aa  316  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  28.85 
 
 		 874 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.64 
 
 		 868 aa  313  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  29.44 
 
 		 874 aa  312  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  29.94 
 
 		 874 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  29.44 
 
 		 874 aa  312  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  30.56 
 
 		 901 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  29.62 
 
 		 874 aa  311  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  30.56 
 
 		 901 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  29.32 
 
 		 874 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  32.97 
 
 		 848 aa  289  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  42.18 
 
 		 1044 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  37.81 
 
 		 961 aa  241  4e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1037 aa  235  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  40.06 
 
 		 1043 aa  230  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  40.44 
 
 		 1037 aa  226  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  31.2 
 
 		 845 aa  224  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  40.13 
 
 		 1039 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  34.24 
 
 		 1012 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  39.21 
 
 		 1046 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1073 aa  219  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  39.5 
 
 		 1039 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  30.96 
 
 		 915 aa  208  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  33.54 
 
 		 996 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  28.52 
 
 		 831 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1099 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1125 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  32.87 
 
 		 984 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>