67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1124 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  60.56 
 
 
845 aa  1053    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  57.24 
 
 
915 aa  1031    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  100 
 
 
831 aa  1731    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  35.26 
 
 
984 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  36.92 
 
 
1012 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  35.25 
 
 
1073 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  34.92 
 
 
1099 aa  318  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  39.81 
 
 
996 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  34.57 
 
 
1125 aa  306  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  27.81 
 
 
805 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  27.13 
 
 
805 aa  258  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  32.37 
 
 
762 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  28.2 
 
 
838 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  32.78 
 
 
762 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  26.09 
 
 
843 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  27.43 
 
 
839 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  33.27 
 
 
749 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  28.18 
 
 
844 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  27.54 
 
 
837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  32.89 
 
 
870 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  39.08 
 
 
1037 aa  230  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  27.36 
 
 
840 aa  230  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  28.33 
 
 
961 aa  227  8e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  30.27 
 
 
823 aa  227  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  38.79 
 
 
1037 aa  225  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  37.46 
 
 
1043 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  37.23 
 
 
1046 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  32.31 
 
 
848 aa  222  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  30.58 
 
 
810 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  27.36 
 
 
825 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  28.1 
 
 
868 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  37.64 
 
 
1039 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  37.91 
 
 
1044 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  37.64 
 
 
1039 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  27.23 
 
 
825 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  28.43 
 
 
868 aa  217  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  29.02 
 
 
874 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  29.3 
 
 
827 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  29.12 
 
 
874 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  29.12 
 
 
874 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  28.84 
 
 
874 aa  214  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  27.73 
 
 
874 aa  213  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  32.33 
 
 
808 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  28.74 
 
 
801 aa  211  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  26.44 
 
 
1382 aa  211  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  30.31 
 
 
869 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  32.19 
 
 
825 aa  211  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  31.42 
 
 
860 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  31.42 
 
 
860 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  27.69 
 
 
874 aa  207  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  24.43 
 
 
862 aa  207  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  32.63 
 
 
852 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  32.22 
 
 
808 aa  204  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  27.25 
 
 
874 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  27.95 
 
 
874 aa  201  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  27.27 
 
 
808 aa  201  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  30.78 
 
 
901 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  30.78 
 
 
901 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  28.12 
 
 
815 aa  199  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  30.67 
 
 
808 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  29.31 
 
 
801 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  26.33 
 
 
881 aa  195  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  29.87 
 
 
805 aa  193  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  31.3 
 
 
812 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  25.69 
 
 
855 aa  193  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  29.05 
 
 
791 aa  190  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  30 
 
 
812 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>