67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  60.56 
 
 
831 aa  1063    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  100 
 
 
845 aa  1739    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  54.09 
 
 
915 aa  957    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  34.22 
 
 
984 aa  361  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  40.28 
 
 
1073 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  38.83 
 
 
1012 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  43.89 
 
 
1099 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  39.35 
 
 
996 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  36.57 
 
 
1125 aa  293  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  29.24 
 
 
805 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  28.92 
 
 
870 aa  258  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  28.75 
 
 
837 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  29.25 
 
 
843 aa  247  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  28.11 
 
 
805 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  33.47 
 
 
762 aa  244  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  33.2 
 
 
762 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  29.93 
 
 
749 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  29.01 
 
 
844 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  30.22 
 
 
848 aa  239  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  31.26 
 
 
808 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  28.77 
 
 
827 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  32.26 
 
 
810 aa  232  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  41.37 
 
 
1044 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 
1382 aa  230  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  27.42 
 
 
839 aa  228  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  27.6 
 
 
838 aa  226  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  27.31 
 
 
825 aa  225  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  27.31 
 
 
825 aa  225  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  31.01 
 
 
869 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  31.16 
 
 
823 aa  223  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  31.08 
 
 
815 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  26.94 
 
 
862 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  28.43 
 
 
840 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  28.34 
 
 
801 aa  216  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  38.38 
 
 
1043 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  32.82 
 
 
825 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  29.34 
 
 
881 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  39.23 
 
 
1046 aa  212  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  32.83 
 
 
852 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  33.02 
 
 
801 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  28.73 
 
 
868 aa  211  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  33.53 
 
 
961 aa  210  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  25.5 
 
 
855 aa  208  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  38.61 
 
 
1037 aa  207  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  38.33 
 
 
1037 aa  207  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  27.83 
 
 
868 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  31.17 
 
 
805 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  28.17 
 
 
874 aa  202  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  38.42 
 
 
1039 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  38.42 
 
 
1039 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  27.96 
 
 
808 aa  201  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  30.57 
 
 
901 aa  200  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  30.57 
 
 
901 aa  200  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  29.23 
 
 
874 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  29.12 
 
 
874 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  27.43 
 
 
874 aa  199  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  27.43 
 
 
874 aa  199  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  27.46 
 
 
808 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  28.07 
 
 
874 aa  197  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  31.47 
 
 
808 aa  197  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  26.32 
 
 
874 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  37.61 
 
 
860 aa  194  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  31.58 
 
 
812 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  37.61 
 
 
860 aa  194  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  27.14 
 
 
874 aa  191  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  29.1 
 
 
791 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  31.16 
 
 
812 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>