67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0833 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  59.2 
 
 		 808 aa  872    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  58.89 
 
 		 808 aa  863    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 805 aa  1621    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  60.65 
 
 		 808 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  58.52 
 
 		 801 aa  875    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  53.36 
 
 		 791 aa  761    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  57.52 
 
 		 812 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  56.52 
 
 		 812 aa  805    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  56.9 
 
 		 808 aa  841    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  42.24 
 
 		 840 aa  600  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  42.91 
 
 		 838 aa  597  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  43.76 
 
 		 839 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  42.87 
 
 		 843 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  43.99 
 
 		 844 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  39.68 
 
 		 825 aa  529  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  39.68 
 
 		 825 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  38.94 
 
 		 827 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  38.47 
 
 		 1382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  36.06 
 
 		 823 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  37.7 
 
 		 815 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  34.23 
 
 		 810 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  36.43 
 
 		 869 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  38.03 
 
 		 860 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  38.03 
 
 		 860 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  37.96 
 
 		 825 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  34.23 
 
 		 862 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  35.24 
 
 		 801 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  35.2 
 
 		 762 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  35.67 
 
 		 762 aa  347  7e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  32.45 
 
 		 837 aa  330  9e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  28.86 
 
 		 855 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  34.11 
 
 		 749 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  31.88 
 
 		 805 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  33.06 
 
 		 881 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  30.14 
 
 		 874 aa  302  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  29.95 
 
 		 868 aa  302  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.92 
 
 		 868 aa  299  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  29.07 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  29.07 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  28.84 
 
 		 874 aa  296  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  29.07 
 
 		 874 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  31.13 
 
 		 870 aa  293  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  28.72 
 
 		 874 aa  293  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  28.84 
 
 		 874 aa  293  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  31.2 
 
 		 805 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  28.65 
 
 		 874 aa  291  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  27.51 
 
 		 901 aa  287  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  27.51 
 
 		 901 aa  287  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  32.44 
 
 		 848 aa  269  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  37.85 
 
 		 961 aa  247  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  41.02 
 
 		 1044 aa  241  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  42.14 
 
 		 852 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1037 aa  234  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  39.55 
 
 		 1046 aa  233  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  39.54 
 
 		 1043 aa  233  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1037 aa  230  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  38.34 
 
 		 1039 aa  214  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  37.73 
 
 		 1039 aa  207  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  31.17 
 
 		 845 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 984 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1012 aa  197  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  29.87 
 
 		 831 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  27.38 
 
 		 915 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1073 aa  188  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  32.32 
 
 		 996 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1099 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1125 aa  161  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>