67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0211 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  45.75 
 
 
825 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  45.87 
 
 
825 aa  694    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  100 
 
 
827 aa  1687    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  42.49 
 
 
1382 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  43.99 
 
 
839 aa  612  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  42.62 
 
 
843 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  43.01 
 
 
840 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  42.74 
 
 
838 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  42.58 
 
 
844 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  41.85 
 
 
808 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  42.36 
 
 
808 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  40.32 
 
 
862 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  40.7 
 
 
801 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  40.22 
 
 
815 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  41.5 
 
 
812 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  40.6 
 
 
808 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  41.19 
 
 
808 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  39.12 
 
 
869 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  41.38 
 
 
812 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  37.48 
 
 
823 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  40.48 
 
 
860 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  38.94 
 
 
805 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  40.48 
 
 
860 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  38.47 
 
 
791 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  37.38 
 
 
810 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  39.85 
 
 
825 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  37.39 
 
 
801 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  33.45 
 
 
837 aa  366  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  34.79 
 
 
749 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  33.11 
 
 
762 aa  357  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  32.66 
 
 
762 aa  355  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  32.15 
 
 
805 aa  352  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  32.89 
 
 
805 aa  348  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  31 
 
 
874 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  29.01 
 
 
855 aa  340  7e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  30.88 
 
 
874 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  30.88 
 
 
874 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  30.92 
 
 
874 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  32.68 
 
 
870 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  30.72 
 
 
874 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  30.46 
 
 
874 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  30.55 
 
 
874 aa  336  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  30.58 
 
 
868 aa  330  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  30.08 
 
 
868 aa  328  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  34.39 
 
 
852 aa  327  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  30.42 
 
 
874 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  30.68 
 
 
881 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  37.27 
 
 
901 aa  310  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  37.27 
 
 
901 aa  310  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  31.77 
 
 
848 aa  283  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  42.86 
 
 
1043 aa  259  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  42.69 
 
 
1044 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  44.38 
 
 
1037 aa  248  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  43.02 
 
 
1046 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  44.07 
 
 
1037 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  33.46 
 
 
1012 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  39.66 
 
 
1039 aa  231  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  28.32 
 
 
845 aa  228  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  38.53 
 
 
961 aa  228  5.0000000000000005e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
1073 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  39.08 
 
 
1039 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  29.3 
 
 
831 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  30.4 
 
 
1099 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  32.16 
 
 
915 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  33.07 
 
 
1125 aa  202  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  30.76 
 
 
984 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  33.08 
 
 
996 aa  190  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>