67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4033 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  46.29 
 
 
862 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  48.39 
 
 
815 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  70.62 
 
 
860 aa  1046    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1625    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  64.64 
 
 
869 aa  1009    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  70.62 
 
 
860 aa  1046    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  42.73 
 
 
823 aa  579  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  39.43 
 
 
810 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  41.98 
 
 
825 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  41.98 
 
 
825 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  41.72 
 
 
1382 aa  512  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  40.59 
 
 
827 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  40.17 
 
 
839 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  39.63 
 
 
843 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  38.82 
 
 
844 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  38 
 
 
838 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  38.98 
 
 
840 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  39.25 
 
 
808 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  39.92 
 
 
801 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  40.2 
 
 
808 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  39.12 
 
 
808 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  39.87 
 
 
808 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  38.01 
 
 
801 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  40.5 
 
 
812 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  38.2 
 
 
805 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  39.75 
 
 
812 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  38.39 
 
 
791 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  35.43 
 
 
805 aa  352  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  34.27 
 
 
837 aa  343  8e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  32.75 
 
 
870 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  37.04 
 
 
749 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  34.86 
 
 
805 aa  317  5e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  35.72 
 
 
852 aa  313  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  32.89 
 
 
762 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  29.38 
 
 
874 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  32.83 
 
 
762 aa  310  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  29.45 
 
 
868 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  30.47 
 
 
868 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  29.8 
 
 
874 aa  307  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  29.93 
 
 
874 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  27.48 
 
 
855 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  29.69 
 
 
874 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  29.69 
 
 
874 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  29.72 
 
 
874 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  31.15 
 
 
881 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  28.72 
 
 
874 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  29.27 
 
 
874 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  35.9 
 
 
848 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  27.53 
 
 
901 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  27.53 
 
 
901 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  35.4 
 
 
1012 aa  244  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  43.03 
 
 
1044 aa  241  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  40.88 
 
 
961 aa  237  6e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  43.81 
 
 
1037 aa  237  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  42.06 
 
 
1043 aa  232  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  35.44 
 
 
1073 aa  230  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  42.86 
 
 
1037 aa  229  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  32.82 
 
 
845 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  32.19 
 
 
831 aa  224  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  33.33 
 
 
984 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  42.4 
 
 
1046 aa  222  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  40.11 
 
 
1039 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  32.68 
 
 
1125 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  34.82 
 
 
996 aa  212  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  39.55 
 
 
1039 aa  208  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  29.08 
 
 
915 aa  198  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  36.58 
 
 
1099 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>