67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0816 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  46.15 
 
 
762 aa  671    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  46.28 
 
 
762 aa  674    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  100 
 
 
749 aa  1545    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  34.93 
 
 
837 aa  469  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  40.12 
 
 
805 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  36.8 
 
 
805 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  38.5 
 
 
881 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  34.71 
 
 
839 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  34.86 
 
 
852 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  34.31 
 
 
855 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  38.65 
 
 
843 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  36.83 
 
 
870 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  35.01 
 
 
838 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  35.57 
 
 
874 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  35.57 
 
 
874 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  38.25 
 
 
844 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  35.43 
 
 
868 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  35.42 
 
 
874 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  38.18 
 
 
840 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  35.64 
 
 
868 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  35.77 
 
 
874 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  35.49 
 
 
874 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  35.77 
 
 
874 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  35.77 
 
 
874 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  34.9 
 
 
874 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  34.79 
 
 
827 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  37.76 
 
 
808 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  35.61 
 
 
848 aa  363  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
1382 aa  360  4e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  35.75 
 
 
862 aa  353  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  36.83 
 
 
815 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  36.59 
 
 
808 aa  349  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  36.01 
 
 
808 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  36.7 
 
 
808 aa  342  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  32.41 
 
 
825 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  35.37 
 
 
825 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  35.71 
 
 
801 aa  336  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  34.4 
 
 
791 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  34.65 
 
 
823 aa  327  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  37.14 
 
 
901 aa  320  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  37.14 
 
 
901 aa  320  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  34.48 
 
 
860 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  34.26 
 
 
805 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  34.48 
 
 
860 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  35.94 
 
 
812 aa  317  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  39.57 
 
 
801 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  34 
 
 
810 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  36.9 
 
 
825 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  35.26 
 
 
869 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  33.48 
 
 
812 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  45.62 
 
 
1043 aa  297  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  37.7 
 
 
1012 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  45 
 
 
1044 aa  284  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  35.51 
 
 
1073 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  43.03 
 
 
1046 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  34.51 
 
 
1125 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  40.45 
 
 
961 aa  253  8.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  40.94 
 
 
1037 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  40.94 
 
 
1037 aa  247  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  33.27 
 
 
831 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  33.65 
 
 
845 aa  239  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  41.25 
 
 
1039 aa  239  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  31.17 
 
 
984 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  40.62 
 
 
1039 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  38.73 
 
 
1099 aa  214  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  29.84 
 
 
915 aa  206  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  34.52 
 
 
996 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>