67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0085 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1789    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  46.18 
 
 		 881 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  49.59 
 
 		 874 aa  847    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  49.07 
 
 		 868 aa  841    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  48.67 
 
 		 868 aa  834    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  49.59 
 
 		 874 aa  853    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  51.16 
 
 		 874 aa  873    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  52.99 
 
 		 901 aa  949    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  52.99 
 
 		 901 aa  949    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  49.48 
 
 		 874 aa  846    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  44.94 
 
 		 870 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  49.36 
 
 		 874 aa  852    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  49.48 
 
 		 874 aa  846    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  49.59 
 
 		 874 aa  849    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  49.36 
 
 		 874 aa  845    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  37.5 
 
 		 848 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  35.39 
 
 		 762 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  35.26 
 
 		 762 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  32.71 
 
 		 837 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  29.1 
 
 		 805 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  30.72 
 
 		 805 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  34.45 
 
 		 749 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  29.37 
 
 		 843 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  29.18 
 
 		 827 aa  347  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  29.94 
 
 		 839 aa  343  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  30.06 
 
 		 801 aa  339  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  32.15 
 
 		 815 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  28.86 
 
 		 805 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  29.61 
 
 		 838 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  28.86 
 
 		 840 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  29.4 
 
 		 844 aa  322  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  28.85 
 
 		 852 aa  320  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  31.61 
 
 		 808 aa  320  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  31.24 
 
 		 808 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  28.7 
 
 		 823 aa  312  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  30.54 
 
 		 869 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 		 1382 aa  310  8e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  27.5 
 
 		 862 aa  310  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  30.12 
 
 		 808 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  27.11 
 
 		 961 aa  308  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  28.59 
 
 		 825 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  28.56 
 
 		 825 aa  300  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  30.59 
 
 		 860 aa  294  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  30.59 
 
 		 860 aa  294  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  30.65 
 
 		 791 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  35.73 
 
 		 808 aa  293  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  34.41 
 
 		 812 aa  290  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  30.19 
 
 		 825 aa  290  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  27.71 
 
 		 810 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  34.24 
 
 		 801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  30.04 
 
 		 812 aa  281  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  42.81 
 
 		 1044 aa  267  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1073 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1012 aa  258  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1043 aa  257  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  40.92 
 
 		 1046 aa  249  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1037 aa  248  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1039 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  38.72 
 
 		 1037 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  38.72 
 
 		 1039 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  28.17 
 
 		 996 aa  238  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1099 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  25.97 
 
 		 984 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1125 aa  230  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  25.94 
 
 		 845 aa  207  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  25.95 
 
 		 831 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  28.13 
 
 		 915 aa  195  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>