67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1251 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0512  hypothetical protein  49.73 
 
 
1073 aa  1062    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.293326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1251  hypothetical protein  100 
 
 
1125 aa  2330    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0565  hypothetical protein  43.84 
 
 
1012 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.906894  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4410  Protein of unknown function DUF2309  37.92 
 
 
996 aa  351  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2598  hypothetical protein  40.28 
 
 
984 aa  343  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5483  hypothetical protein  46.8 
 
 
1099 aa  327  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.688472  normal  0.967507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1124  Protein of unknown function DUF2309  34.57 
 
 
831 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988751  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17870  hypothetical protein  36.57 
 
 
845 aa  292  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2069  hypothetical protein  27.86 
 
 
1037 aa  288  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951906  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1990  hypothetical protein  27.71 
 
 
1037 aa  285  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0708  hypothetical protein  30 
 
 
915 aa  270  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1325  Protein of unknown function DUF2309  34.49 
 
 
870 aa  266  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0547  hypothetical protein  27.97 
 
 
961 aa  265  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0297  Protein of unknown function DUF2309  33.45 
 
 
837 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0816  Protein of unknown function DUF2309  34.51 
 
 
749 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.512183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3190  hypothetical protein  31.37 
 
 
874 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0931  hypothetical protein  33.95 
 
 
805 aa  252  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429596  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2873  hypothetical protein  31.14 
 
 
874 aa  251  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0275  hypothetical protein  32.28 
 
 
762 aa  251  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1610  hypothetical protein  33.28 
 
 
881 aa  250  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.499379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3189  hypothetical protein  31.63 
 
 
874 aa  250  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2958  hypothetical protein  31.37 
 
 
874 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3182  hypothetical protein  31.37 
 
 
874 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0280  hypothetical protein  32.09 
 
 
762 aa  248  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2937  hypothetical protein  32.04 
 
 
874 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3197  hypothetical protein  30.52 
 
 
874 aa  243  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2652  hypothetical protein  33.64 
 
 
843 aa  243  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2073  hypothetical protein  30.84 
 
 
868 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3175  hypothetical protein  30.66 
 
 
868 aa  237  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1107  hypothetical protein  30.31 
 
 
874 aa  237  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1381  hypothetical protein  32.96 
 
 
844 aa  234  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296761  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2653  hypothetical protein  40.5 
 
 
1043 aa  231  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0488  hypothetical protein  32.79 
 
 
901 aa  231  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0475  hypothetical protein  32.79 
 
 
901 aa  231  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0298  hypothetical protein  31.61 
 
 
805 aa  229  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0661924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3853  hypothetical protein  31.87 
 
 
838 aa  227  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  unclonable  0.0000169222 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0085  hypothetical protein  33.27 
 
 
855 aa  226  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0907  Protein of unknown function DUF2309  39.37 
 
 
1046 aa  226  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0567  hypothetical protein  33.09 
 
 
840 aa  224  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.038441  normal  0.839812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2891  hypothetical protein  32.06 
 
 
839 aa  220  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0564064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0752  Protein of unknown function DUF2309  31.63 
 
 
848 aa  219  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0879  Protein of unknown function DUF2309  38.84 
 
 
1044 aa  218  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.754113  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1185  hypothetical protein  30.3 
 
 
862 aa  205  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5850  hypothetical protein  30.46 
 
 
869 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.875802  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0211  Protein of unknown function DUF2309  33.07 
 
 
827 aa  202  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1358  hypothetical protein  31.51 
 
 
825 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0618412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1661  hypothetical protein  31.51 
 
 
825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4033  hypothetical protein  32.68 
 
 
825 aa  199  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222793  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1369  hypothetical protein  30.64 
 
 
801 aa  198  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3405  hypothetical protein  30.66 
 
 
808 aa  196  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4329  hypothetical protein  34.5 
 
 
1039 aa  194  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4323  hypothetical protein  34.5 
 
 
1039 aa  194  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0997  hypothetical protein  30.84 
 
 
791 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514673  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1258  hypothetical protein  29.59 
 
 
801 aa  181  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.997019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2020  hypothetical protein  30.84 
 
 
815 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.0419958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2475  hypothetical protein  29.48 
 
 
852 aa  181  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0854  hypothetical protein  28.62 
 
 
823 aa  178  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0319  hypothetical protein  29.38 
 
 
808 aa  177  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00907  hypothetical protein  32.53 
 
 
812 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0500036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3800  hypothetical protein  32.83 
 
 
810 aa  164  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.915018 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4558  hypothetical protein  33.75 
 
 
860 aa  162  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3486  hypothetical protein  33.75 
 
 
860 aa  162  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0833  hypothetical protein  28.25 
 
 
805 aa  161  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.499921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
1382 aa  159  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0652  hypothetical protein  34.04 
 
 
808 aa  155  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2332  hypothetical protein  32.83 
 
 
808 aa  148  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5662  hypothetical protein  33.02 
 
 
812 aa  144  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>