More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0853 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
518 aa  1036    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  41.84 
 
 
537 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  40.47 
 
 
516 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  39.64 
 
 
527 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  39.64 
 
 
527 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  44.9 
 
 
542 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  47.25 
 
 
524 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.13 
 
 
519 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  48.16 
 
 
510 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 
524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  47.02 
 
 
519 aa  217  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  37.81 
 
 
528 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  42.86 
 
 
546 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.14 
 
 
523 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.28 
 
 
546 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  43.51 
 
 
470 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.09 
 
 
516 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  46.48 
 
 
519 aa  206  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  46.28 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  38.93 
 
 
526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  43.79 
 
 
523 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0212  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
551 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  36.77 
 
 
535 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  47.39 
 
 
554 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 
1382 aa  187  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  39.72 
 
 
501 aa  179  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.15 
 
 
559 aa  156  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.14 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.4 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  34.39 
 
 
559 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.35 
 
 
560 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.61 
 
 
658 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564852  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  30.53 
 
 
614 aa  141  3e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.05 
 
 
566 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.31 
 
 
639 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0084  NADH dehydrogenase subunit 5  31.48 
 
 
498 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 
762 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  31.14 
 
 
768 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  31.49 
 
 
770 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  29.14 
 
 
692 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.6 
 
 
759 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  34.57 
 
 
506 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  34.57 
 
 
506 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.14 
 
 
758 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.97 
 
 
770 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  32.87 
 
 
641 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.45 
 
 
750 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  28.53 
 
 
695 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  31.84 
 
 
633 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.13 
 
 
642 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.34 
 
 
625 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  33.58 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  31.31 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0151  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.78 
 
 
673 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  30.47 
 
 
529 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01661  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.42 
 
 
670 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  27.82 
 
 
694 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.42 
 
 
673 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  29.22 
 
 
620 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  32.65 
 
 
638 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.33 
 
 
668 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.29 
 
 
679 aa  133  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  28.65 
 
 
692 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  30.98 
 
 
679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  30.64 
 
 
682 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.33 
 
 
687 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.68 
 
 
686 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  29.3 
 
 
695 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  31.82 
 
 
620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.5 
 
 
649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  29.02 
 
 
715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01771  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  35.25 
 
 
678 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.473718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.58 
 
 
649 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.07 
 
 
642 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  29.32 
 
 
713 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  32.04 
 
 
612 aa  131  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  30.64 
 
 
686 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  29.32 
 
 
713 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.26 
 
 
668 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  29.14 
 
 
684 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  29.14 
 
 
684 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  29.14 
 
 
684 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  29.14 
 
 
684 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  32.14 
 
 
642 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.63 
 
 
650 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4733  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.21 
 
 
689 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0478983  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.69 
 
 
669 aa  130  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  30.03 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  30.03 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.12 
 
 
685 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  29.17 
 
 
621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1336  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.48 
 
 
690 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>