More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2476 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2476  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
459 aa  867    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.23 
 
 
559 aa  156  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.29 
 
 
560 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  41.58 
 
 
495 aa  153  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  38.27 
 
 
559 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.09 
 
 
565 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.09 
 
 
565 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  33.09 
 
 
506 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.67 
 
 
516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  32.71 
 
 
506 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.68 
 
 
566 aa  142  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  35.93 
 
 
542 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
524 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0084  NADH dehydrogenase subunit 5  44.39 
 
 
498 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0297  NADH dehydrogenase (quinone)  39.41 
 
 
494 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00538088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  37.15 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0751  NADH dehydrogenase subunit 5  39.51 
 
 
505 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  36.46 
 
 
470 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1336  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39 
 
 
690 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.25 
 
 
523 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1324  NADH dehydrogenase subunit 5  35.71 
 
 
500 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
528 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4733  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.1 
 
 
689 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0478983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1609  NADH dehydrogenase subunit 5  38.83 
 
 
498 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.38 
 
 
519 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  37.77 
 
 
642 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2072  NADH dehydrogenase subunit 5  36.36 
 
 
510 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1357  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.46 
 
 
688 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592157  normal  0.205396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.7 
 
 
639 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  30.66 
 
 
526 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0487  NADH dehydrogenase subunit 5  34.91 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2959  NADH dehydrogenase subunit 5  36.32 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.20551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3190  NADH dehydrogenase subunit 5  36.32 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0474  NADH dehydrogenase subunit 5  34.91 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3183  NADH dehydrogenase subunit 5  36.32 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  34.98 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  38.85 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  40.38 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  40.38 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  38.38 
 
 
519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.43 
 
 
628 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  37.41 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  39.22 
 
 
638 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2938  NADH dehydrogenase subunit 5  35.06 
 
 
510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1250  NADH dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3198  NADH dehydrogenase subunit 5  34.63 
 
 
510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3191  NADH dehydrogenase subunit 5  39.27 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.538533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.92 
 
 
643 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  37.39 
 
 
641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  41.56 
 
 
518 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3176  NADH dehydrogenase subunit 5  38.74 
 
 
510 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2874  NADH dehydrogenase subunit 5  40.34 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.781902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  36.01 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1106  NADH dehydrogenase subunit 5  39.89 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00149705  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  43.15 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  36.7 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  39.92 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.88 
 
 
625 aa  113  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  31.39 
 
 
610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  34.73 
 
 
633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  45.04 
 
 
516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  35.34 
 
 
636 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  32.72 
 
 
537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  38.92 
 
 
642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  38.92 
 
 
642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.48 
 
 
696 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  39.69 
 
 
626 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 
519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.27 
 
 
642 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.9 
 
 
546 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  33.46 
 
 
642 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  34.9 
 
 
546 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.79 
 
 
641 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  32.83 
 
 
620 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01661  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.36 
 
 
670 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  29.63 
 
 
695 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.92 
 
 
800 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
711 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.92 
 
 
800 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.36 
 
 
673 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.39 
 
 
759 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1874  NADH dehydrogenase subunit L  40.49 
 
 
626 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.815784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.49 
 
 
691 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.697145  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  31.18 
 
 
770 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.35 
 
 
673 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.73 
 
 
952 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.56 
 
 
770 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  33.95 
 
 
535 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4024  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.49 
 
 
693 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  33.57 
 
 
685 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1817  NADH dehydrogenase subunit L  31.4 
 
 
640 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000815464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  31.76 
 
 
689 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  28.66 
 
 
682 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  36.9 
 
 
662 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 
762 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.96 
 
 
703 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.55 
 
 
649 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.96 
 
 
705 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.96 
 
 
703 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>