More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1250 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1250  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
513 aa  1024    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0513  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  53.55 
 
 
509 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0566  NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5/L, N-terminal:NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.46 
 
 
508 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0758963  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.5 
 
 
667 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  35.83 
 
 
696 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4409  NADH dehydrogenase (quinone)  33.57 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488164  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.04 
 
 
667 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.04 
 
 
667 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.31 
 
 
628 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.64 
 
 
639 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  35.08 
 
 
603 aa  207  5e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.78 
 
 
691 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.697145  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4024  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.78 
 
 
693 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.59 
 
 
642 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  33.33 
 
 
695 aa  206  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17880  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 5  33.01 
 
 
622 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.67 
 
 
630 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1977  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.17 
 
 
665 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  36.53 
 
 
611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  35.67 
 
 
642 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  35 
 
 
693 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.81 
 
 
668 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  36.53 
 
 
613 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  36.53 
 
 
613 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  33.84 
 
 
636 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  36.53 
 
 
613 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  36.53 
 
 
611 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.78 
 
 
691 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  35.08 
 
 
670 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.4 
 
 
676 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.25 
 
 
668 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  36.84 
 
 
669 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.46 
 
 
634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  36.27 
 
 
612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5482  NADH dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
847 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120155  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  35.65 
 
 
613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.07 
 
 
687 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  35.15 
 
 
641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.81 
 
 
667 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.61 
 
 
668 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  35.76 
 
 
614 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  36.12 
 
 
616 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  35.76 
 
 
614 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  35.76 
 
 
614 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.62 
 
 
622 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  35.93 
 
 
615 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  35.05 
 
 
611 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  35.05 
 
 
611 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  33.15 
 
 
695 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  35.05 
 
 
613 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  34.02 
 
 
636 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  36.83 
 
 
615 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
652 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  35.05 
 
 
613 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.85 
 
 
625 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 
613 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  36.83 
 
 
615 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
651 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.74 
 
 
613 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01661  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.24 
 
 
670 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  35.98 
 
 
615 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.24 
 
 
673 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  34.67 
 
 
664 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 
613 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 
613 aa  194  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0151  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.8 
 
 
673 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  34.74 
 
 
613 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.61 
 
 
636 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  36.86 
 
 
613 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  36.09 
 
 
616 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  32.69 
 
 
669 aa  193  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  37.8 
 
 
617 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  34.73 
 
 
662 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.07 
 
 
659 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.4 
 
 
631 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  33.6 
 
 
720 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  37.8 
 
 
617 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  35.56 
 
 
633 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  34.69 
 
 
610 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.84 
 
 
642 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  35.76 
 
 
669 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.32 
 
 
666 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  37.1 
 
 
613 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  35.69 
 
 
624 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.03 
 
 
704 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  35.57 
 
 
596 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.97 
 
 
625 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  35.91 
 
 
596 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1125  NADH dehydrogenase (quinone)  34.28 
 
 
623 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.994939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  31.95 
 
 
682 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  35.8 
 
 
617 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  33.6 
 
 
720 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.74 
 
 
703 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  35.31 
 
 
616 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.45 
 
 
618 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  36.98 
 
 
638 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  33.52 
 
 
692 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.74 
 
 
703 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.25 
 
 
642 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.51 
 
 
675 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>