More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0167 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  100 
 
 
603 aa  1194    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.03 
 
 
667 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.88 
 
 
667 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.55 
 
 
630 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.86 
 
 
627 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.46 
 
 
642 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.5 
 
 
634 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  40 
 
 
636 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.01 
 
 
667 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.12 
 
 
639 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.72 
 
 
801 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289204  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.2 
 
 
639 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.2 
 
 
639 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.2 
 
 
639 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.06 
 
 
666 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43 
 
 
618 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.31 
 
 
668 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.96 
 
 
710 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.86 
 
 
628 aa  352  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  39.52 
 
 
613 aa  349  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  39.52 
 
 
613 aa  349  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.42 
 
 
642 aa  349  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  39.52 
 
 
613 aa  349  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.01 
 
 
614 aa  348  1e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  39.45 
 
 
613 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.94 
 
 
679 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.52 
 
 
613 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  39.45 
 
 
613 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  39.52 
 
 
611 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1817  NADH dehydrogenase subunit L  38.94 
 
 
640 aa  347  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000815464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  38.97 
 
 
613 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  39.27 
 
 
613 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  39.27 
 
 
613 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  39.27 
 
 
613 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.06 
 
 
613 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  38.94 
 
 
611 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  39.1 
 
 
611 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  39.35 
 
 
611 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  39.18 
 
 
613 aa  345  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.47 
 
 
669 aa  343  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.45 
 
 
625 aa  343  7e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  38.86 
 
 
616 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  38.86 
 
 
615 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0149  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.04 
 
 
618 aa  342  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000427063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36 
 
 
650 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.42 
 
 
641 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  35.26 
 
 
650 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.1 
 
 
683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  39.25 
 
 
616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  40.69 
 
 
616 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.15 
 
 
652 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  36.47 
 
 
679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  36.47 
 
 
679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  36.47 
 
 
679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.24 
 
 
671 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  36.47 
 
 
679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  36.69 
 
 
679 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  36.9 
 
 
679 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  36.9 
 
 
679 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  42.66 
 
 
596 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.41 
 
 
666 aa  336  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  42.29 
 
 
596 aa  336  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  36.41 
 
 
682 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  35.78 
 
 
654 aa  336  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.48 
 
 
672 aa  336  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  40.04 
 
 
688 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  41.79 
 
 
719 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.14 
 
 
660 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  42.55 
 
 
724 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  37.05 
 
 
662 aa  334  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  35.32 
 
 
682 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.46 
 
 
675 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  36.38 
 
 
686 aa  333  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.23 
 
 
674 aa  333  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  38.03 
 
 
636 aa  333  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  37.36 
 
 
686 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.07 
 
 
621 aa  333  6e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  36.23 
 
 
657 aa  333  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  35.32 
 
 
638 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  36.38 
 
 
657 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  40.04 
 
 
614 aa  333  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  40.04 
 
 
614 aa  333  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  40.04 
 
 
614 aa  333  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.02 
 
 
675 aa  332  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  37.77 
 
 
624 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.48 
 
 
678 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  42.77 
 
 
596 aa  332  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  40.49 
 
 
695 aa  332  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.35 
 
 
671 aa  332  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.1 
 
 
676 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.73 
 
 
622 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  36.62 
 
 
685 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.37 
 
 
639 aa  331  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  35.5 
 
 
666 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.73 
 
 
651 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  36.53 
 
 
664 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.1 
 
 
621 aa  330  4e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  36.63 
 
 
663 aa  330  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  36.46 
 
 
661 aa  329  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.83 
 
 
662 aa  329  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>