More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1324 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1324  NADH dehydrogenase subunit 5  100 
 
 
500 aa  969    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1609  NADH dehydrogenase subunit 5  52.05 
 
 
498 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3176  NADH dehydrogenase subunit 5  43.99 
 
 
510 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2938  NADH dehydrogenase subunit 5  43.79 
 
 
510 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1106  NADH dehydrogenase subunit 5  46.23 
 
 
510 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00149705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2959  NADH dehydrogenase subunit 5  43.58 
 
 
510 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.20551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2874  NADH dehydrogenase subunit 5  43.38 
 
 
510 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.781902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3183  NADH dehydrogenase subunit 5  43.58 
 
 
510 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3190  NADH dehydrogenase subunit 5  43.58 
 
 
510 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3198  NADH dehydrogenase subunit 5  43.2 
 
 
510 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3191  NADH dehydrogenase subunit 5  42.22 
 
 
510 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.538533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2072  NADH dehydrogenase subunit 5  42.83 
 
 
510 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0084  NADH dehydrogenase subunit 5  40.08 
 
 
498 aa  350  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0487  NADH dehydrogenase subunit 5  40.33 
 
 
494 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0474  NADH dehydrogenase subunit 5  40.33 
 
 
494 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0751  NADH dehydrogenase subunit 5  41.79 
 
 
505 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  38.55 
 
 
506 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  38.17 
 
 
506 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 
499 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.9 
 
 
559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.04 
 
 
560 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
495 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.15 
 
 
565 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.15 
 
 
565 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  33.11 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  35.34 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0297  NADH dehydrogenase (quinone)  35.47 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00538088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.69 
 
 
566 aa  120  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  32.55 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.24 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.8 
 
 
519 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2476  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  48.03 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.82 
 
 
546 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  38.31 
 
 
546 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.95 
 
 
628 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  31.56 
 
 
470 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
519 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  32.17 
 
 
516 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  28.2 
 
 
526 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  35.21 
 
 
510 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  29.4 
 
 
523 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.71 
 
 
652 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  29.72 
 
 
768 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  30.38 
 
 
662 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.46 
 
 
759 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.31 
 
 
667 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.84 
 
 
686 aa  104  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  28.9 
 
 
620 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.13 
 
 
770 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.18 
 
 
653 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  28.27 
 
 
666 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.28 
 
 
523 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  29.84 
 
 
653 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.13 
 
 
698 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.69 
 
 
758 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  29.11 
 
 
650 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 
519 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.57 
 
 
671 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.26 
 
 
654 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4988  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.82 
 
 
736 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  27.78 
 
 
620 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  28.61 
 
 
666 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.97 
 
 
762 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.53 
 
 
650 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  28.66 
 
 
657 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  36.47 
 
 
518 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.45 
 
 
667 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  30.14 
 
 
636 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.97 
 
 
685 aa  99.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  27.99 
 
 
664 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  28.66 
 
 
657 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  29.28 
 
 
770 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  31.96 
 
 
642 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  28.11 
 
 
620 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  28.94 
 
 
654 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  27.15 
 
 
612 aa  97.8  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.94 
 
 
660 aa  97.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.58 
 
 
654 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  30.43 
 
 
663 aa  96.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0549  NADH dehydrogenase subunit L  29.26 
 
 
661 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  29.73 
 
 
719 aa  96.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.73 
 
 
653 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  32.41 
 
 
633 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  28.36 
 
 
617 aa  96.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  27.65 
 
 
617 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29.24 
 
 
691 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  28.02 
 
 
596 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  42.65 
 
 
1382 aa  96.3  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  29.79 
 
 
537 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  30.14 
 
 
641 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  27.18 
 
 
669 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.17 
 
 
642 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  28.1 
 
 
596 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  30.75 
 
 
648 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  45.83 
 
 
527 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  28.95 
 
 
701 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.89 
 
 
675 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>