More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4988 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4988  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
736 aa  1481    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.3 
 
 
726 aa  760    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.1 
 
 
725 aa  746    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.28 
 
 
733 aa  631  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  39.56 
 
 
695 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  41 
 
 
693 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  41.21 
 
 
670 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.61 
 
 
691 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1977  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  42.92 
 
 
665 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  40.74 
 
 
687 aa  449  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.38 
 
 
696 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  41.29 
 
 
668 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.8 
 
 
651 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  40.08 
 
 
669 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.06 
 
 
691 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.697145  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.49 
 
 
667 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4024  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.83 
 
 
693 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  41.01 
 
 
668 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.06 
 
 
669 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0151  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.06 
 
 
673 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.19 
 
 
673 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.19 
 
 
645 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 
642 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  39.07 
 
 
620 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.21 
 
 
624 aa  412  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01661  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.06 
 
 
670 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01771  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.84 
 
 
678 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.473718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.81 
 
 
683 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  38.88 
 
 
620 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  38.78 
 
 
620 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  38.93 
 
 
620 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.39 
 
 
628 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  38.93 
 
 
620 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.69 
 
 
656 aa  399  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.13 
 
 
642 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  39.29 
 
 
620 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  42.05 
 
 
604 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  39.22 
 
 
620 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  39.23 
 
 
620 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  39.56 
 
 
620 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  38.96 
 
 
620 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.9 
 
 
710 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.67 
 
 
667 aa  379  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  39.55 
 
 
724 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.3 
 
 
630 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  40.35 
 
 
682 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.86 
 
 
678 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  40.09 
 
 
692 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  40.74 
 
 
686 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.69 
 
 
704 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  40.76 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  40.76 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  40.76 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  40.76 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.92 
 
 
695 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  40.19 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  40.35 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1289  F420H2 dehydrogenase subunit L  39.97 
 
 
665 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  36.48 
 
 
636 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  40.19 
 
 
679 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.37 
 
 
642 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.26 
 
 
667 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  40.6 
 
 
686 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.8 
 
 
675 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.4 
 
 
671 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.09 
 
 
627 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.86 
 
 
634 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  39.41 
 
 
617 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  40.8 
 
 
686 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  40.67 
 
 
670 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  40.41 
 
 
695 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.12 
 
 
768 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.46 
 
 
770 aa  369  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  40.07 
 
 
692 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  40.07 
 
 
689 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.67 
 
 
758 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.57 
 
 
660 aa  365  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  39.39 
 
 
684 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  41.31 
 
 
617 aa  364  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  39.39 
 
 
684 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  39.39 
 
 
684 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  39.39 
 
 
684 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
684 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  39.55 
 
 
684 aa  363  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  47.03 
 
 
654 aa  363  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  39.23 
 
 
684 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.53 
 
 
666 aa  361  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.91 
 
 
762 aa  361  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.39 
 
 
654 aa  361  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.64 
 
 
667 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.21 
 
 
642 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2579  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.72 
 
 
823 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.08345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  39.61 
 
 
713 aa  359  9e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.33 
 
 
676 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.72 
 
 
676 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  39.61 
 
 
713 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.72 
 
 
823 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.862723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1269  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.77 
 
 
819 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.57 
 
 
639 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.18 
 
 
670 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>