281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_21450 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_21450  Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  100 
 
 
489 aa  925    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13420  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  42.38 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.439429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2789  putative phytochrome sensor protein  39.29 
 
 
448 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3089  transcriptional regulator  38.98 
 
 
466 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1466  putative GAF sensor protein  37.62 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4955  putative GAF sensor protein  38.87 
 
 
439 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.925113  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2091  transcriptional regulator  37.04 
 
 
417 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1777  putative phytochrome sensor protein  35.77 
 
 
460 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00250628  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4057  putative phytochrome sensor protein  36.87 
 
 
409 aa  186  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4927  putative phytochrome sensor protein  37.45 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0169  putative phytochrome sensor protein  36.82 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234973  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3273  putative GAF sensor protein  39.53 
 
 
438 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0958  GAF domain-containing protein  35.64 
 
 
426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.165428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0896  putative phytochrome sensor protein  34.77 
 
 
426 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0355459 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4882  putative phytochrome sensor protein  41.18 
 
 
445 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1088  putative phytochrome sensor protein  34.16 
 
 
471 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0281  putative phytochrome sensor protein  32.59 
 
 
503 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1781  putative phytochrome sensor protein  31.14 
 
 
488 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0108  GAF domain protein  31.21 
 
 
422 aa  150  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0472317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0878  putative GAF sensor protein  32.3 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3971  transcriptional regulator domain-containing protein  30.1 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4867  putative phytochrome sensor protein  42.33 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752345  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1094  transcriptional regulator domain protein  31.23 
 
 
556 aa  116  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2991  putative phytochrome sensor protein  30.61 
 
 
406 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000148631  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1985  putative phytochrome sensor protein  41.72 
 
 
501 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2979  hypothetical protein  39.23 
 
 
194 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2144  putative phytochrome sensor protein  32.72 
 
 
422 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0926933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.38 
 
 
643 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1166  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.23 
 
 
675 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.321857  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0619  putative GAF sensor protein  35.44 
 
 
437 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0626  putative GAF sensor protein  35.44 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1944  GAF domain protein  34.67 
 
 
410 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0639  putative GAF sensor protein  35.44 
 
 
437 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2239  putative phytochrome sensor protein  34.21 
 
 
439 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1028  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.47 
 
 
642 aa  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11420  sigma54-dependent activator protein  32.81 
 
 
664 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21230  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  35.94 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.259809  normal  0.259363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0790  putative GAF sensor protein  30.69 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2406  putative phytochrome sensor protein  41.94 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0123  putative GAF sensor protein  35.59 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0710006  normal  0.587329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1337  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.61 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0602  hypothetical protein  39.49 
 
 
529 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.779269  normal  0.126723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6248  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.37 
 
 
708 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3466  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.82 
 
 
677 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0584  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  35.52 
 
 
560 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4400  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.91 
 
 
669 aa  76.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.916028  normal  0.547202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2521  putative acetoin operon transcriptional activator  27.22 
 
 
616 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1488  transcriptional regulator domain protein  28.35 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3906  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.51 
 
 
680 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  28.24 
 
 
655 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1790  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.94 
 
 
753 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000112297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2794  acetoin operon transcriptional activator, putative  27.22 
 
 
616 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000141006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2815  putative acetoin operon transcriptional activator  26.63 
 
 
616 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.183654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2772  putative acetoin operon transcriptional activator  26.04 
 
 
616 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4264  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.78 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20940  sigma54-dependent activator protein AcxR  29.49 
 
 
664 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6170  helix-turn-helix, Fis-type  32.2 
 
 
677 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0094108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0944  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.69 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2563  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.01 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.067017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2574  acetoin operon transcriptional activator  26.63 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.500823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2530  sigma-54-dependent transcriptional activator  26.63 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000702364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2495  sigma-54-dependent transcriptional activator  26.63 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.292908  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2761  acetoin operon transcriptional activator  26.63 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2768  putative acetoin operon transcriptional activator  26.63 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00807774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2951  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.94 
 
 
639 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0236757  normal  0.346853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3637  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator  34.69 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  29.03 
 
 
671 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3508  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.71 
 
 
631 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62585  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0285  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.25 
 
 
687 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0956  transcriptional regulatory protein  31.5 
 
 
678 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3467  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.27 
 
 
636 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6153  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.82 
 
 
689 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.936504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2301  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.27 
 
 
636 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4104  sigma54 specific transcriptional regulator  31.3 
 
 
661 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2469  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.42 
 
 
636 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5969  putative phytochrome sensor protein  31.17 
 
 
663 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118543  normal  0.0102226 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5524  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 
640 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3606  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.13 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833415  normal  0.824204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0479  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.65 
 
 
712 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4569  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.35 
 
 
638 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.9 
 
 
661 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4363  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  26.52 
 
 
653 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0608  sigma-54 dependent transcriptional activator  30.52 
 
 
664 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482359 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4979  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.25 
 
 
619 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.178803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2095  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5897  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.17 
 
 
669 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0087  helix-turn-helix Fis-type  33.58 
 
 
588 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3234  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.1 
 
 
699 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0436708  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2010  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
454 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  26.21 
 
 
679 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3427  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.94 
 
 
648 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.535868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1741  sigma-54 dependent transcriptional regulator  32.93 
 
 
609 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.606989  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6164  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.52 
 
 
666 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4269  DNA-binding transcriptional regulator DhaR  37.36 
 
 
648 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0289337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1375  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  26.19 
 
 
644 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1000  helix-turn-helix, Fis-type  34.75 
 
 
661 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2614  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
682 aa  64.3  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7189  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.82 
 
 
662 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000334896  normal  0.517977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5158  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.56 
 
 
680 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.493898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0309  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.63 
 
 
657 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>