41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0584 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0584  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 560 aa  1084    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1088  putative phytochrome sensor protein  43.41 
 
 		 471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2979  hypothetical protein  43.09 
 
 		 194 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1781  putative phytochrome sensor protein  38.78 
 
 		 488 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0281  putative phytochrome sensor protein  36.76 
 
 		 503 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13420  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  38.04 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.439429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1985  putative phytochrome sensor protein  40.12 
 
 		 501 aa  90.1  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0958  GAF domain-containing protein  40.12 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.165428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0896  putative phytochrome sensor protein  40.74 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0355459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0602  hypothetical protein  39.88 
 
 		 529 aa  87.4  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.779269  normal  0.126723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2978  Tetratricopeptide TPR_4  34.55 
 
 		 632 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3089  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973377  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4882  putative phytochrome sensor protein  35.11 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2091  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4057  putative phytochrome sensor protein  36.31 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0108  GAF domain protein  34.29 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0472317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3971  transcriptional regulator domain-containing protein  35.96 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1466  putative GAF sensor protein  35.33 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21450  Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  35.52 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2789  putative phytochrome sensor protein  33.86 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0169  putative phytochrome sensor protein  35.98 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234973  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3273  putative GAF sensor protein  35.2 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1094  transcriptional regulator domain protein  32.28 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4867  putative phytochrome sensor protein  33.57 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4955  putative GAF sensor protein  33.11 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.925113  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1777  putative phytochrome sensor protein  30.93 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00250628  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4927  putative phytochrome sensor protein  33.11 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2239  putative phytochrome sensor protein  33.1 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0123  putative GAF sensor protein  35.51 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0710006  normal  0.587329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0878  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0619  putative GAF sensor protein  36.19 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0639  putative GAF sensor protein  36.19 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0626  putative GAF sensor protein  36.19 
 
 		 438 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3418  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 973 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  36.22 
 
 		 1070 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2406  putative phytochrome sensor protein  41.43 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0790  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  36 
 
 		 1068 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21230  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  45.12 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.259809  normal  0.259363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1488  transcriptional regulator domain protein  43.08 
 
 		 414 aa  43.9  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2991  putative phytochrome sensor protein  40 
 
 		 406 aa  43.9  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000148631  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>