32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2979 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0584  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 560 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0602  hypothetical protein  47.02 
 
 		 529 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.779269  normal  0.126723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1088  putative phytochrome sensor protein  43.75 
 
 		 471 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13420  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  40.24 
 
 		 463 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.439429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1985  putative phytochrome sensor protein  41.21 
 
 		 501 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4867  putative phytochrome sensor protein  41.25 
 
 		 538 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0281  putative phytochrome sensor protein  40.85 
 
 		 503 aa  99  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21450  Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  39.23 
 
 		 489 aa  98.6  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1781  putative phytochrome sensor protein  39.88 
 
 		 488 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0896  putative phytochrome sensor protein  40.48 
 
 		 426 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0355459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2091  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 417 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0958  GAF domain-containing protein  42.26 
 
 		 426 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.165428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0169  putative phytochrome sensor protein  38.18 
 
 		 440 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234973  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2789  putative phytochrome sensor protein  36.14 
 
 		 448 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3089  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 466 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4927  putative phytochrome sensor protein  40.67 
 
 		 464 aa  84.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0108  GAF domain protein  33.89 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0472317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1777  putative phytochrome sensor protein  34.9 
 
 		 460 aa  81.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00250628  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3971  transcriptional regulator domain-containing protein  39.16 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1094  transcriptional regulator domain protein  34.85 
 
 		 556 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1466  putative GAF sensor protein  39.13 
 
 		 441 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4057  putative phytochrome sensor protein  40.98 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4955  putative GAF sensor protein  35.62 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.925113  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4882  putative phytochrome sensor protein  32.72 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3273  putative GAF sensor protein  34.03 
 
 		 438 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0878  putative GAF sensor protein  29.53 
 
 		 428 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0202  hypothetical protein  35.57 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2239  putative phytochrome sensor protein  35.85 
 
 		 439 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21230  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  44.44 
 
 		 419 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.259809  normal  0.259363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0123  putative GAF sensor protein  38.71 
 
 		 435 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0710006  normal  0.587329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0790  putative GAF sensor protein  32.69 
 
 		 441 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>