27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0602 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  993    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.779269  normal  0.126723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2979  hypothetical protein  46.34 
 
 		 194 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0584  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  39.88 
 
 		 560 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2789  putative phytochrome sensor protein  40.68 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21450  Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  40.35 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0958  GAF domain-containing protein  43.9 
 
 		 426 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.165428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3089  transcriptional regulator  38.29 
 
 		 466 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0896  putative phytochrome sensor protein  41.46 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0355459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1088  putative phytochrome sensor protein  39.01 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0281  putative phytochrome sensor protein  39.39 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1781  putative phytochrome sensor protein  39.07 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13420  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  37.42 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.439429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0169  putative phytochrome sensor protein  37.42 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234973  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4057  putative phytochrome sensor protein  39.41 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4927  putative phytochrome sensor protein  41.04 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4867  putative phytochrome sensor protein  34.97 
 
 		 538 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0108  GAF domain protein  36.63 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0472317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1094  transcriptional regulator domain protein  31.56 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2091  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3971  transcriptional regulator domain-containing protein  36.3 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1466  putative GAF sensor protein  38 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4955  putative GAF sensor protein  39.39 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.925113  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1985  putative phytochrome sensor protein  37.65 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1777  putative phytochrome sensor protein  32.41 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00250628  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4882  putative phytochrome sensor protein  32.34 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3273  putative GAF sensor protein  35.95 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0202  hypothetical protein  31.39 
 
 		 187 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>