More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0169 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0169  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 
440 aa  839    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234973  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4057  putative phytochrome sensor protein  47.17 
 
 
409 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1466  putative GAF sensor protein  45.77 
 
 
441 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1777  putative phytochrome sensor protein  43.02 
 
 
460 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00250628  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4955  putative GAF sensor protein  43.68 
 
 
439 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.925113  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4927  putative phytochrome sensor protein  46.9 
 
 
464 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0108  GAF domain protein  41.61 
 
 
422 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0472317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0896  putative phytochrome sensor protein  46.98 
 
 
426 aa  249  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0355459 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4882  putative phytochrome sensor protein  43.61 
 
 
445 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0958  GAF domain-containing protein  45.73 
 
 
426 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.165428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2789  putative phytochrome sensor protein  39.24 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3089  transcriptional regulator  38.62 
 
 
466 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13420  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  41 
 
 
463 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.439429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2091  transcriptional regulator  39.36 
 
 
417 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3273  putative GAF sensor protein  41.62 
 
 
438 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21450  Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  37.31 
 
 
489 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0878  putative GAF sensor protein  33.09 
 
 
428 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1088  putative phytochrome sensor protein  34.67 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3971  transcriptional regulator domain-containing protein  37.15 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4867  putative phytochrome sensor protein  40.65 
 
 
538 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2239  putative phytochrome sensor protein  42 
 
 
439 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1985  putative phytochrome sensor protein  41.33 
 
 
501 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  39.6 
 
 
679 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 
643 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21230  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  33.61 
 
 
419 aa  120  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.259809  normal  0.259363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2991  putative phytochrome sensor protein  36.71 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000148631  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0619  putative GAF sensor protein  38.19 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0281  putative phytochrome sensor protein  37.84 
 
 
503 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0626  putative GAF sensor protein  37.69 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1094  transcriptional regulator domain protein  40.61 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0639  putative GAF sensor protein  37.69 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2406  putative phytochrome sensor protein  41.98 
 
 
411 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2144  putative phytochrome sensor protein  40.68 
 
 
422 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0926933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0123  putative GAF sensor protein  39.44 
 
 
435 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0710006  normal  0.587329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1781  putative phytochrome sensor protein  36.13 
 
 
488 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2772  putative acetoin operon transcriptional activator  28.22 
 
 
616 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2521  putative acetoin operon transcriptional activator  28.22 
 
 
616 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2574  acetoin operon transcriptional activator  27.8 
 
 
616 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.500823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2530  sigma-54-dependent transcriptional activator  27.8 
 
 
616 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2768  putative acetoin operon transcriptional activator  27.8 
 
 
616 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00807774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2815  putative acetoin operon transcriptional activator  28.22 
 
 
616 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.183654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2761  acetoin operon transcriptional activator  27.8 
 
 
616 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11420  sigma54-dependent activator protein  35.32 
 
 
664 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2495  sigma-54-dependent transcriptional activator  27.8 
 
 
616 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.292908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3466  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.65 
 
 
677 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1166  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.94 
 
 
675 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.321857  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2563  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  27.8 
 
 
616 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.067017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1337  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.85 
 
 
679 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6153  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.7 
 
 
689 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.936504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2794  acetoin operon transcriptional activator, putative  31.58 
 
 
616 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000141006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0944  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.63 
 
 
673 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6170  helix-turn-helix, Fis-type  36.95 
 
 
677 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0094108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1944  GAF domain protein  38.2 
 
 
410 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 
661 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4104  sigma54 specific transcriptional regulator  35.16 
 
 
661 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20940  sigma54-dependent activator protein AcxR  33.33 
 
 
664 aa  100  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.16 
 
 
655 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0790  putative GAF sensor protein  37.02 
 
 
441 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  28.65 
 
 
671 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.61 
 
 
637 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1000  helix-turn-helix, Fis-type  32.84 
 
 
661 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2095  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0750  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.5 
 
 
576 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1836  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.66 
 
 
601 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5524  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.32 
 
 
640 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2979  hypothetical protein  38.18 
 
 
194 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3906  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31 
 
 
680 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3538  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.5 
 
 
660 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3637  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator  36.1 
 
 
646 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4363  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.43 
 
 
653 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2010  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
454 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3606  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.16 
 
 
647 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833415  normal  0.824204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3392  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.09 
 
 
689 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549461  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0343  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  28.37 
 
 
640 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00036469  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0956  transcriptional regulatory protein  34.52 
 
 
678 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4479  sigma-54 dependent transcriptional regulator  32.8 
 
 
616 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1028  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.67 
 
 
642 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1413  sigma-54 dependent transcriptional regulator  27.78 
 
 
587 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5308  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.56 
 
 
634 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0711362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3388  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.56 
 
 
637 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4979  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.56 
 
 
637 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219279  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0890  sigma-54 dependent transcriptional regulator  41.94 
 
 
646 aa  87  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3573  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.34 
 
 
591 aa  86.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0698  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.62 
 
 
637 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5127  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator, HTH Fis-type family  31.96 
 
 
654 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.53901  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1741  sigma-54 dependent transcriptional regulator  35.36 
 
 
609 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.606989  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7189  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 
662 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000334896  normal  0.517977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4400  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.65 
 
 
669 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.916028  normal  0.547202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0932  sigma54 specific transcriptional regulator  33.18 
 
 
653 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0365  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.15 
 
 
633 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0633679  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3641  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.62 
 
 
691 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0250  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.52 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0251  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.97 
 
 
628 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000347396 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2160  sigma-54 activated regulatory protein  41.13 
 
 
724 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4922  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.62 
 
 
629 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0800  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.13 
 
 
646 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4403  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.62 
 
 
628 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3434  sigma-54 dependent transcriptional regulator  32.65 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.66609  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2813  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.01 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.475478  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5897  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.88 
 
 
669 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>