More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1985 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1985  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 
501 aa  952    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1088  putative phytochrome sensor protein  51.45 
 
 
471 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0281  putative phytochrome sensor protein  43.68 
 
 
503 aa  310  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1781  putative phytochrome sensor protein  45.63 
 
 
488 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1094  transcriptional regulator domain protein  37.8 
 
 
556 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4867  putative phytochrome sensor protein  37.11 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2239  putative phytochrome sensor protein  40.87 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0123  putative GAF sensor protein  37.67 
 
 
435 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0710006  normal  0.587329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2991  putative phytochrome sensor protein  39.2 
 
 
406 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000148631  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2406  putative phytochrome sensor protein  42.27 
 
 
411 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0790  putative GAF sensor protein  35.28 
 
 
441 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21230  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  40.16 
 
 
419 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.259809  normal  0.259363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0626  putative GAF sensor protein  34.79 
 
 
438 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0639  putative GAF sensor protein  34.79 
 
 
437 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0619  putative GAF sensor protein  34.57 
 
 
437 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1944  GAF domain protein  35.93 
 
 
410 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2144  putative phytochrome sensor protein  38.59 
 
 
422 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0926933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1488  transcriptional regulator domain protein  35.23 
 
 
414 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2789  putative phytochrome sensor protein  38.1 
 
 
448 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0958  GAF domain-containing protein  32.23 
 
 
426 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.165428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3273  putative GAF sensor protein  34.37 
 
 
438 aa  136  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2091  transcriptional regulator  42.17 
 
 
417 aa  127  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4955  putative GAF sensor protein  41.38 
 
 
439 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.925113  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0169  putative phytochrome sensor protein  42.25 
 
 
440 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234973  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3089  transcriptional regulator  35.87 
 
 
466 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4927  putative phytochrome sensor protein  39.73 
 
 
464 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0878  putative GAF sensor protein  39.52 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1466  putative GAF sensor protein  39.23 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4104  sigma54 specific transcriptional regulator  35.56 
 
 
661 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13420  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  38.33 
 
 
463 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.439429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3508  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.66 
 
 
631 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62585  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5524  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37 
 
 
640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  33.47 
 
 
679 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1337  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.17 
 
 
679 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6170  helix-turn-helix, Fis-type  34.96 
 
 
677 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0094108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3971  transcriptional regulator domain-containing protein  39.43 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0896  putative phytochrome sensor protein  37.28 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0355459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0944  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.67 
 
 
673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2800  putative AcoR, transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  38.1 
 
 
645 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1500  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.1 
 
 
645 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18284  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2979  hypothetical protein  41.58 
 
 
194 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4057  putative phytochrome sensor protein  38.04 
 
 
409 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1777  putative phytochrome sensor protein  40.21 
 
 
460 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00250628  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11420  sigma54-dependent activator protein  36.09 
 
 
664 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3906  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  33.48 
 
 
680 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.38 
 
 
643 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3637  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator  35.38 
 
 
646 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0108  GAF domain protein  39.74 
 
 
422 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0472317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1166  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.67 
 
 
675 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.321857  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1375  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.12 
 
 
644 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1028  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.63 
 
 
642 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0956  transcriptional regulatory protein  35.59 
 
 
678 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21450  Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  41.72 
 
 
489 aa  103  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1556  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.33 
 
 
657 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3606  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.34 
 
 
647 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833415  normal  0.824204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3466  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.91 
 
 
677 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297654  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6153  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.39 
 
 
689 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.936504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3392  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  27.03 
 
 
689 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549461  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2010  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
454 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2095  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
454 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4400  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.32 
 
 
669 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.916028  normal  0.547202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0396  sigma-54 dependent transcriptional activator  34.29 
 
 
664 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1646  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.25 
 
 
689 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.346775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4882  putative phytochrome sensor protein  44 
 
 
445 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2772  putative acetoin operon transcriptional activator  28.5 
 
 
616 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2495  sigma-54-dependent transcriptional activator  22.83 
 
 
616 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.292908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2794  acetoin operon transcriptional activator, putative  27.98 
 
 
616 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000141006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2815  putative acetoin operon transcriptional activator  27.46 
 
 
616 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.183654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2521  putative acetoin operon transcriptional activator  28.5 
 
 
616 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2486  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.57 
 
 
672 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.141183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5308  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.99 
 
 
634 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0711362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2574  acetoin operon transcriptional activator  27.46 
 
 
616 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.500823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2530  sigma-54-dependent transcriptional activator  27.46 
 
 
616 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2563  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  26.94 
 
 
616 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.067017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2761  acetoin operon transcriptional activator  27.46 
 
 
616 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2768  putative acetoin operon transcriptional activator  27.46 
 
 
616 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00807774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3388  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.99 
 
 
637 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4979  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.99 
 
 
637 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219279  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1744  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.52 
 
 
652 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0785861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0087  helix-turn-helix Fis-type  33.18 
 
 
588 aa  94.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0608  sigma-54 dependent transcriptional activator  31.35 
 
 
664 aa  94.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0584  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 
560 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4363  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  28.8 
 
 
653 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2092  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.22 
 
 
676 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000637573  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4922  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.11 
 
 
629 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4403  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.11 
 
 
628 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0698  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.11 
 
 
637 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.24 
 
 
637 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5127  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator, HTH Fis-type family  30.58 
 
 
654 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.53901  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2510  transcriptional regulator  32.34 
 
 
615 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583312  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4264  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.77 
 
 
602 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1790  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.88 
 
 
753 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000112297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4569  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.82 
 
 
638 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3427  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.82 
 
 
648 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.535868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.87 
 
 
1045 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3641  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.11 
 
 
691 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0735  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.96 
 
 
683 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.431182  normal  0.0765632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  40.79 
 
 
587 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0479  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.46 
 
 
712 aa  87.8  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4895  Fis family transcriptional regulator  31.79 
 
 
615 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>