More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0673 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  41.1 
 
 
1745 aa  655    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0105  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.99 
 
 
975 aa  897    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.811343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1203  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  53.22 
 
 
880 aa  962    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0314  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.48 
 
 
882 aa  982    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.53282  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2161  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  55.99 
 
 
880 aa  1000    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0353  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  47.48 
 
 
974 aa  884    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03720  DNA-directed RNA polymerase ii largest subunit, putative  40.6 
 
 
1786 aa  660    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0185  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.42 
 
 
889 aa  845    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.144445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0348  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  49.94 
 
 
1263 aa  844    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1161  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.96 
 
 
889 aa  976    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3692  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  57.24 
 
 
880 aa  1056    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.127113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0300  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.48 
 
 
882 aa  982    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814827  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1090  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  57.72 
 
 
895 aa  1045    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000457669  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0034  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  51.12 
 
 
886 aa  931    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000287475  normal  0.0408299 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0789  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  78.83 
 
 
888 aa  1469    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.804481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0513  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  46.91 
 
 
972 aa  872    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1932  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  55.21 
 
 
879 aa  997    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413115  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1310  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  90.66 
 
 
889 aa  1701    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0052  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.34 
 
 
886 aa  997    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.421691 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75374  DNA-directed RNA polymerase II largest subunit (RNA polymerase II subunit 1) (B220)  41.7 
 
 
1739 aa  637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2092  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  50.11 
 
 
884 aa  886    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1177  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  57.47 
 
 
883 aa  1051    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000130646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2152  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.01 
 
 
976 aa  887    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511073  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  51.03 
 
 
884 aa  890    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0180439  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0215  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  89.31 
 
 
889 aa  1682    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0673  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  100 
 
 
889 aa  1830    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.657483  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0702  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  50.63 
 
 
884 aa  889    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00638403  hitchhiker  0.00894808 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0029  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  57.69 
 
 
876 aa  1064    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2322  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  49.71 
 
 
884 aa  878    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0946262  hitchhiker  0.0000535013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0782  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  51.66 
 
 
1013 aa  772    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0720962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0608  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  90.78 
 
 
889 aa  1698    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0285  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  55.86 
 
 
888 aa  1001    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10316  hypothetical protein similar to RNA polymerase III (Broad)  36.88 
 
 
1445 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  40.07 
 
 
1646 aa  620  1e-176  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66237  DNA-directed RNA polymerase III subunit C1 (RPO31)  37.05 
 
 
1448 aa  602  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24022  predicted protein  38.21 
 
 
1395 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000888169  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00390  DNA-directed RNA polymerase iii largest subunit, putative  36.34 
 
 
1466 aa  595  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297029  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42100  rna polymerase C 157 kDa  38.43 
 
 
1281 aa  591  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  38.92 
 
 
1706 aa  580  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43496  predicted protein  35.36 
 
 
1663 aa  348  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622972  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03140  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
1727 aa  346  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73507  alpha subunit of RNA polymerase I  32.26 
 
 
1644 aa  332  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.305254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2340  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.14 
 
 
1181 aa  280  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0020825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2467  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.76 
 
 
1164 aa  269  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.48 
 
 
1204 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00687501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1531  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  27.38 
 
 
1174 aa  266  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00270247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1194 aa  260  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00902184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0100  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.08 
 
 
1199 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0975  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  27.71 
 
 
1427 aa  258  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00330358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5202  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.99 
 
 
1203 aa  258  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000165097  unclonable  1.46015e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.07 
 
 
1203 aa  258  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0611195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0208  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.85 
 
 
1185 aa  257  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00134006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1980  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.4 
 
 
1207 aa  257  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0104  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.85 
 
 
1199 aa  257  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000439156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0124  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  257  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00422887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0285  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.99 
 
 
1223 aa  257  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  256  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00223812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  257  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  256  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0713  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.47 
 
 
1404 aa  257  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0115  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  257  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.839749999999999e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0134  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.21 
 
 
1203 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000348699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0184  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.2 
 
 
1207 aa  255  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0118718  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.38 
 
 
1207 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0336645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0566  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.38 
 
 
1207 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.218097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01100  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  28.47 
 
 
1165 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000289877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0599  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.98 
 
 
1395 aa  254  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.275775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0482  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  26.8 
 
 
1323 aa  253  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0187  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  27.14 
 
 
1218 aa  254  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00978383  normal  0.014525 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002174  DNA-directed RNA polymerase beta' subunit  27.75 
 
 
1400 aa  253  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.840465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0363  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  25.98 
 
 
1401 aa  252  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3445  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  27.64 
 
 
1406 aa  252  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.638126  hitchhiker  0.00045796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00224  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.66 
 
 
1400 aa  252  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3765  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1405 aa  251  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2731  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.55 
 
 
1401 aa  251  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0279  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.09 
 
 
1175 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000274196  decreased coverage  0.0000517957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0190  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.67 
 
 
1405 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.87384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0194  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.67 
 
 
1405 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498009  hitchhiker  0.000390877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4062  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.67 
 
 
1405 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000858149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0142  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1408 aa  250  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0021761  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4464  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.67 
 
 
1405 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0388  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.06 
 
 
1401 aa  250  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2948  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  30 
 
 
1317 aa  250  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0178  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.64 
 
 
1404 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.273104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0225  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1405 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1491  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.12 
 
 
1211 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0164  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.33 
 
 
1410 aa  249  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1405 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.508945  hitchhiker  0.0000984081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0188  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1405 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790536  decreased coverage  0.000914175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1405 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.314811  hitchhiker  0.00000822489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3333  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.62 
 
 
1413 aa  248  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762028  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3188  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.04 
 
 
1415 aa  248  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00697  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.16 
 
 
1390 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08780  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.14 
 
 
1399 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0182127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0831  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.14 
 
 
1399 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.01 
 
 
1407 aa  247  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2865  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.62 
 
 
1401 aa  247  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2718  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  26.8 
 
 
1212 aa  247  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1169  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  30.67 
 
 
1475 aa  247  8e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00437832  unclonable  0.000000255692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>