More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0789 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_10316  hypothetical protein similar to RNA polymerase III (Broad)  37.98 
 
 
1445 aa  635    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  41.26 
 
 
1745 aa  653    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1203  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.86 
 
 
880 aa  974    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1161  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.01 
 
 
889 aa  991    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1310  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  80.29 
 
 
889 aa  1521    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0215  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  80.41 
 
 
889 aa  1526    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  50.06 
 
 
884 aa  891    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0180439  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03720  DNA-directed RNA polymerase ii largest subunit, putative  41.1 
 
 
1786 aa  656    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2161  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.98 
 
 
880 aa  998    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2152  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.79 
 
 
976 aa  900    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1090  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  55.99 
 
 
895 aa  1026    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000457669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3692  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  56.79 
 
 
880 aa  1044    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.127113 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0513  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.54 
 
 
972 aa  899    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1932  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  55.07 
 
 
879 aa  996    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413115  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2322  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  50.06 
 
 
884 aa  888    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0946262  hitchhiker  0.0000535013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0782  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.29 
 
 
1013 aa  802    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0720962  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0185  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.48 
 
 
889 aa  851    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.144445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2092  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  49.66 
 
 
884 aa  892    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0052  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  55.75 
 
 
886 aa  1021    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.421691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0105  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  49.79 
 
 
975 aa  912    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.811343 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1177  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  57.3 
 
 
883 aa  1060    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  42.07 
 
 
1646 aa  664    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0300  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  53.98 
 
 
882 aa  985    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0314  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  53.98 
 
 
882 aa  985    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.53282  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0034  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  52.08 
 
 
886 aa  948    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000287475  normal  0.0408299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0353  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  49.26 
 
 
974 aa  915    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0029  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  56.98 
 
 
876 aa  1055    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0673  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  78.83 
 
 
889 aa  1501    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.657483  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75374  DNA-directed RNA polymerase II largest subunit (RNA polymerase II subunit 1) (B220)  42.38 
 
 
1739 aa  665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0285  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  54.71 
 
 
888 aa  976    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0789  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  100 
 
 
888 aa  1827    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.804481  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0702  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  49.38 
 
 
884 aa  882    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00638403  hitchhiker  0.00894808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0348  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  48.21 
 
 
1263 aa  848    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0608  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  80.41 
 
 
889 aa  1525    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00390  DNA-directed RNA polymerase iii largest subunit, putative  38.93 
 
 
1466 aa  634  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297029  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42100  rna polymerase C 157 kDa  39.84 
 
 
1281 aa  629  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24022  predicted protein  39.59 
 
 
1395 aa  630  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000888169  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66237  DNA-directed RNA polymerase III subunit C1 (RPO31)  37.81 
 
 
1448 aa  619  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  39.26 
 
 
1706 aa  602  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03140  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 
1727 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43496  predicted protein  34.16 
 
 
1663 aa  339  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622972  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73507  alpha subunit of RNA polymerase I  30.84 
 
 
1644 aa  323  9.000000000000001e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.305254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2467  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.83 
 
 
1164 aa  288  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0208  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.56 
 
 
1185 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00134006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2340  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.64 
 
 
1181 aa  280  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0020825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1531  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  27.37 
 
 
1174 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00270247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2725  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.03 
 
 
1165 aa  275  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0213072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  29.47 
 
 
1204 aa  274  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00687501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0860  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  29.17 
 
 
1157 aa  273  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000858214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0187  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  29.46 
 
 
1218 aa  273  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00978383  normal  0.014525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0975  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  28.44 
 
 
1427 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00330358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0279  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.57 
 
 
1175 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000274196  decreased coverage  0.0000517957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1980  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.35 
 
 
1207 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01100  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  28.62 
 
 
1165 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000289877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2948  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  30.86 
 
 
1317 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0805  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.76 
 
 
1163 aa  268  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000908086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1194 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00902184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  267  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.67 
 
 
1203 aa  267  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0611195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5202  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.79 
 
 
1203 aa  266  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000165097  unclonable  1.46015e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0100  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.59 
 
 
1199 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0115  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.839749999999999e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  265  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00223812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  265  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0124  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  265  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00422887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0134  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.35 
 
 
1203 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000348699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0104  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.57 
 
 
1199 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000439156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3686  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.89 
 
 
1255 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0482  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  30.93 
 
 
1323 aa  262  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0285  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.62 
 
 
1223 aa  262  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.85 
 
 
1155 aa  261  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00696954  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0161  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.37 
 
 
1216 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2718  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  27.48 
 
 
1212 aa  260  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.61 
 
 
1169 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00151961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00697  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.9 
 
 
1390 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0599  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.75 
 
 
1395 aa  259  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.275775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0217  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.32 
 
 
1154 aa  258  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0184  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.55 
 
 
1207 aa  258  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0118718  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1491  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.44 
 
 
1211 aa  257  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0388  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.33 
 
 
1401 aa  256  9e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1824  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.97 
 
 
1220 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0363  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.33 
 
 
1401 aa  256  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2035  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.7 
 
 
1406 aa  255  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002174  DNA-directed RNA polymerase beta' subunit  26.62 
 
 
1400 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.840465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1844  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  28.45 
 
 
1212 aa  254  7e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00224  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.46 
 
 
1400 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0831  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.98 
 
 
1399 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2161  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  30.82 
 
 
1295 aa  253  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08780  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.98 
 
 
1399 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0182127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2706  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  29.91 
 
 
1500 aa  253  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4436  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.07 
 
 
1407 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1597  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  30.49 
 
 
1502 aa  253  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4221  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.07 
 
 
1407 aa  252  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4476  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.07 
 
 
1407 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4529  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.07 
 
 
1407 aa  252  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1374  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  25.6 
 
 
1233 aa  252  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3915  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  26.55 
 
 
1399 aa  253  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0709  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  30.69 
 
 
1408 aa  253  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4037  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  27.07 
 
 
1407 aa  252  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0134963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>