More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3280 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3280  SL44-1; basic proline-rich protein  100 
 
 
272 aa  513  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0087795  normal  0.0783046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  42.04 
 
 
297 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.94 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  40.21 
 
 
296 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  40.16 
 
 
301 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.59 
 
 
319 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  41.37 
 
 
318 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.37 
 
 
308 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  39.36 
 
 
331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  41.87 
 
 
303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  38.8 
 
 
304 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  41.7 
 
 
308 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  38.96 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  33.87 
 
 
321 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.08 
 
 
326 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  35.06 
 
 
294 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  38.87 
 
 
325 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  36.43 
 
 
327 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  38.71 
 
 
305 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.46 
 
 
326 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  39.07 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  39.92 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  38.46 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  38.06 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  38.46 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  37.05 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  40.43 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.46 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  39.43 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  38.74 
 
 
332 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  37.65 
 
 
320 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  39.02 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  36.55 
 
 
317 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  39.36 
 
 
312 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.94 
 
 
299 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  38.78 
 
 
315 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  39.6 
 
 
311 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  39.84 
 
 
306 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  37.41 
 
 
315 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  42.51 
 
 
311 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  38.06 
 
 
320 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  35.1 
 
 
309 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  37.45 
 
 
324 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  36.55 
 
 
317 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  36.73 
 
 
301 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  40.55 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.56 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.99 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.65 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.65 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.11 
 
 
299 aa  138  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  39.6 
 
 
315 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.11 
 
 
299 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  36.14 
 
 
298 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  37.01 
 
 
315 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.76 
 
 
729 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3641  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.1 
 
 
289 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520749  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.4 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  37.65 
 
 
307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  40.96 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  37.85 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  37.85 
 
 
328 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  40.56 
 
 
744 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.65 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0040  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.98 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1894  pyruvate carboxyltransferase  37.65 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  34.53 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.08 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  36.18 
 
 
305 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  34.94 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  37.4 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  39.6 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.25 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.03 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4466  pyruvate carboxyltransferase  36.84 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.03 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  33.92 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.25 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0014  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.17 
 
 
287 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0739  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.14 
 
 
288 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.5891  normal  0.963586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  36.9 
 
 
329 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.51 
 
 
310 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  37.91 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.1 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.87 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  38.4 
 
 
323 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.64 
 
 
314 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  32.66 
 
 
298 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21580  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.69 
 
 
319 aa  128  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594589 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7692  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.12 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  36.18 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.1 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.1 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.1 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.25 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  38.15 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.1 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  38.55 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  36.14 
 
 
333 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  38.55 
 
 
313 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>