More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2390 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 
303 aa  613  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  52.32 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  53.22 
 
 
296 aa  298  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.33 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.54 
 
 
304 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 
307 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  48.15 
 
 
300 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  48.31 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  47.99 
 
 
311 aa  257  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  46.18 
 
 
305 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.65 
 
 
297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  46.07 
 
 
304 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  43.58 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 
314 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  44.18 
 
 
301 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 
298 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  45.35 
 
 
296 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  44.01 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  41.22 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.01 
 
 
314 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  44 
 
 
306 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  46.77 
 
 
303 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 
305 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  43.25 
 
 
301 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.53 
 
 
299 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 
296 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.14 
 
 
299 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  43.27 
 
 
303 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.14 
 
 
299 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.52 
 
 
308 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  44.61 
 
 
301 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  43.31 
 
 
311 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  45.15 
 
 
296 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.18 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 
327 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 
315 aa  225  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.96 
 
 
301 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4266  pyruvate carboxyltransferase  42.49 
 
 
317 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0273285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 
309 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.36 
 
 
297 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.75 
 
 
295 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.51 
 
 
303 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.51 
 
 
303 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.51 
 
 
303 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.51 
 
 
303 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  44.4 
 
 
307 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  41.89 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  44.4 
 
 
307 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.78 
 
 
303 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  44.4 
 
 
307 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.78 
 
 
303 aa  221  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.15 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  44.4 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.18 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1303  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.38 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.15453  normal  0.0935443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.78 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.78 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.8 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  44.6 
 
 
298 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.15 
 
 
303 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 
317 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.28 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  41.39 
 
 
321 aa  219  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.12 
 
 
308 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.45 
 
 
315 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.28 
 
 
315 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.05 
 
 
303 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  43.77 
 
 
315 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.29 
 
 
315 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.66 
 
 
326 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7692  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.01 
 
 
307 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  38.78 
 
 
311 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  42.7 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.31 
 
 
298 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 
308 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.91 
 
 
310 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05477  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.16 
 
 
298 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  41.58 
 
 
315 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 
310 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  43.54 
 
 
305 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  42.26 
 
 
325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 
309 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 
308 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.5 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.7 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.5 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.5 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05273  3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A lyase/3-methylglutaconyl-coenzyme A hydratase (EC 4.1.3.4)(EC 4.2.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6S014]  40.56 
 
 
599 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347874  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  42.54 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  38.94 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.37 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.1 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  40.21 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.34 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  38.52 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  41.16 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  37.67 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  41.16 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>